Question

我需要为R版本3.1.2（2014-10-31）安装rvest包

我收到这些错误：

    checking whether the C++ compiler supports the long long type... no
*** stringi cannot be built. Upgrade your C++ compiler's settings
ERROR: configuration failed for package ‘stringi’
* removing ‘/usr/local/lib64/R/library/stringi’
ERROR: dependency ‘stringi’ is not available for package ‘stringr’
* removing ‘/usr/local/lib64/R/library/stringr’
ERROR: dependency ‘stringr’ is not available for package ‘httr’
* removing ‘/usr/local/lib64/R/library/httr’
ERROR: dependency ‘stringr’ is not available for package ‘selectr’
* removing ‘/usr/local/lib64/R/library/selectr’
ERROR: dependencies ‘httr’, ‘selectr’ are not available for package ‘rvest’
* removing ‘/usr/local/lib64/R/library/rvest’

关于如何安装R包rvest的任何想法？

Answer 1

我的系统是Ubuntu 14.04，R：3.2.3，我遇到了同样的问题。

然后我检查了err meg并尝试安装libcurl4-openssl-dev和libxml2-dev的库：

sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev

sudo apt-get install libxml2-dev

安装完成后，install.packages("rvest")成功。

Answer 2

当我尝试在全新安装的Ubuntu 18.04 上的 Rstudio版本1.1.456中安装Rcurl, XML, rvest, xml2时，我需要诸如tidyverse, DESeq2, RUVSeq之类的依赖项。无论如何，还是有很多缺少的依赖项。这个答案可能适合Ubuntu 18.04的注释，但是我没有那么多声誉。只需在此处尝试总结适用于Ubuntu 18.04的解决方案即可。
在终端中，运行：

sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev libssl-dev sudo apt-get install libxml2-dev

然后在Rstudio中

install.packages("xml2") install.packages("rvest") install.packages("tidyverse") # might need other dependencies installed in Rstudio

tidyverse得到！
在终端中：

sudo apt-get install libmysqlclient-dev ## for RMySQL

然后在Rstudio中

source("https://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("DESeq2") biocLite('RUVSeq') ## might have messages as following

installation path not writeable, unable to update packages: cluster, foreign, MASS, Matrix, mgcv, nlme, survival

在终端机中：

sudo R ## give R the root permission ## in the R session within the terminal pks <- c('cluster', 'foreign', 'MASS', 'Matrix', 'mgcv', 'nlme', 'survival') install.packages(pks) q()

这是我的经验。希望这个人具有良好的通用性。

Answer 3

我能够构建stringi包：

install.packages('stringi', configure.args='--disable-cxx11')

Answer 4

我对这个问题的回答肯定是迟了。然而，有人可能会发现它很有用。

我遇到了同样的问题所以我在shell上运行这个命令：

sudo apt-get upgrade pkg-config

它对我有用。

无法安装rvest包

4 个答案: