我已经开始在Spark 1.4.0中使用Spark SQL和DataFrames。我想在Scala中定义DataFrame上的自定义分区程序,但是没有看到如何执行此操作。
我正在使用的一个数据表包含一个事务列表,按帐户,silimar到以下示例。
Account Date Type Amount
1001 2014-04-01 Purchase 100.00
1001 2014-04-01 Purchase 50.00
1001 2014-04-05 Purchase 70.00
1001 2014-04-01 Payment -150.00
1002 2014-04-01 Purchase 80.00
1002 2014-04-02 Purchase 22.00
1002 2014-04-04 Payment -120.00
1002 2014-04-04 Purchase 60.00
1003 2014-04-02 Purchase 210.00
1003 2014-04-03 Purchase 15.00
至少在最初,大多数计算都会在帐户内的交易之间进行。所以我希望对数据进行分区,以便帐户的所有事务都在同一个Spark分区中。
但我没有看到定义这个的方法。 DataFrame类有一个名为“repartition(Int)”的方法,您可以在其中指定要创建的分区数。但我没有看到任何方法可用于为DataFrame定义自定义分区程序,例如可以为RDD指定。
源数据存储在Parquet中。我确实看到在向Parquet编写DataFrame时,您可以指定要分区的列,因此我可以告诉Parquet通过“帐户”列对其数据进行分区。但是可能有数百万个帐户,如果我正确理解Parquet,它会为每个帐户创建一个独特的目录,这听起来不是一个合理的解决方案。
有没有办法让Spark对这个DataFrame进行分区,以便帐户的所有数据都在同一个分区中?
答案 0 :(得分:161)
SPARK-22614公开了范围分区。
val partitionedByRange = df.repartitionByRange(42, $"k")
partitionedByRange.explain
// == Parsed Logical Plan ==
// 'RepartitionByExpression ['k ASC NULLS FIRST], 42
// +- AnalysisBarrier Project [_1#2 AS k#5, _2#3 AS v#6]
//
// == Analyzed Logical Plan ==
// k: string, v: int
// RepartitionByExpression [k#5 ASC NULLS FIRST], 42
// +- Project [_1#2 AS k#5, _2#3 AS v#6]
// +- LocalRelation [_1#2, _2#3]
//
// == Optimized Logical Plan ==
// RepartitionByExpression [k#5 ASC NULLS FIRST], 42
// +- LocalRelation [k#5, v#6]
//
// == Physical Plan ==
// Exchange rangepartitioning(k#5 ASC NULLS FIRST, 42)
// +- LocalTableScan [k#5, v#6]
SPARK-22389在Data Source API v2中公开了外部格式分区。
在Spark> = 1.6中,可以按列使用分区进行查询和缓存。请参阅:SPARK-11410和SPARK-4849使用repartition
方法:
val df = Seq(
("A", 1), ("B", 2), ("A", 3), ("C", 1)
).toDF("k", "v")
val partitioned = df.repartition($"k")
partitioned.explain
// scala> df.repartition($"k").explain(true)
// == Parsed Logical Plan ==
// 'RepartitionByExpression ['k], None
// +- Project [_1#5 AS k#7,_2#6 AS v#8]
// +- LogicalRDD [_1#5,_2#6], MapPartitionsRDD[3] at rddToDataFrameHolder at <console>:27
//
// == Analyzed Logical Plan ==
// k: string, v: int
// RepartitionByExpression [k#7], None
// +- Project [_1#5 AS k#7,_2#6 AS v#8]
// +- LogicalRDD [_1#5,_2#6], MapPartitionsRDD[3] at rddToDataFrameHolder at <console>:27
//
// == Optimized Logical Plan ==
// RepartitionByExpression [k#7], None
// +- Project [_1#5 AS k#7,_2#6 AS v#8]
// +- LogicalRDD [_1#5,_2#6], MapPartitionsRDD[3] at rddToDataFrameHolder at <console>:27
//
// == Physical Plan ==
// TungstenExchange hashpartitioning(k#7,200), None
// +- Project [_1#5 AS k#7,_2#6 AS v#8]
// +- Scan PhysicalRDD[_1#5,_2#6]
与RDDs
不同,Spark Dataset
(包括Dataset[Row]
a.k.a DataFrame
)目前无法使用自定义分区程序。您通常可以通过创建人工分区列来解决这个问题,但它不会给您相同的灵活性。
您可以做的一件事是在创建DataFrame
import org.apache.spark.sql.types._
import org.apache.spark.sql.Row
import org.apache.spark.HashPartitioner
val schema = StructType(Seq(
StructField("x", StringType, false),
StructField("y", LongType, false),
StructField("z", DoubleType, false)
))
val rdd = sc.parallelize(Seq(
Row("foo", 1L, 0.5), Row("bar", 0L, 0.0), Row("??", -1L, 2.0),
Row("foo", -1L, 0.0), Row("??", 3L, 0.6), Row("bar", -3L, 0.99)
))
val partitioner = new HashPartitioner(5)
val partitioned = rdd.map(r => (r.getString(0), r))
.partitionBy(partitioner)
.values
val df = sqlContext.createDataFrame(partitioned, schema)
由于DataFrame
创建的RDD
只需要一个简单的地图阶段,因此应保留现有的分区布局*:
assert(df.rdd.partitions == partitioned.partitions)
您可以使用相同的方式重新分区现有的DataFrame
:
sqlContext.createDataFrame(
df.rdd.map(r => (r.getInt(1), r)).partitionBy(partitioner).values,
df.schema
)
所以看起来并非不可能。问题仍然存在,如果它有意义的话。我认为大部分时间都没有:
重新分区是一个昂贵的过程。在典型情况下,大多数数据必须被序列化,洗牌和反序列化。另一方面,可以从预分区数据中受益的操作数量相对较小,并且如果内部API不是设计用于利用此属性,则进一步限制。
GROUP BY
的简单聚合 - 可以减少临时缓冲区**的内存占用量,但总体成本要高得多。或多或少相当于groupByKey.mapValues(_.reduce)
(当前行为)vs reduceByKey
(预分区)。不太可能在实践中有用。SqlContext.cacheTable
进行数据压缩。由于它看起来像是使用行程编码,因此应用OrderedRDDFunctions.repartitionAndSortWithinPartitions
可以提高压缩率。 性能高度依赖于密钥的分布。如果它是偏斜的,将导致次优的资源利用率。在最糟糕的情况下,根本不可能完成这项工作。
使用JDBC源进行分区:
JDBC数据源支持Catalyst Optimizer。它可以使用如下:
sqlContext.read.jdbc(url, table, Array("foo = 1", "foo = 3"), props)
它为每个谓词创建一个JDBC分区。请记住,如果使用单个谓词创建的集合不是不相交的,您将在结果表中看到重复项。
partitionBy
中的 DataFrameWriter
方法:
Spark DataFrameWriter
提供partitionBy
方法,可用于在写入时“分区”数据。它使用提供的列集
val df = Seq(
("foo", 1.0), ("bar", 2.0), ("foo", 1.5), ("bar", 2.6)
).toDF("k", "v")
df.write.partitionBy("k").json("/tmp/foo.json")
这使得谓词下推基于键的查询读取:
val df1 = sqlContext.read.schema(df.schema).json("/tmp/foo.json")
df1.where($"k" === "bar")
但它不等同于DataFrame.repartition
。特别是聚合:
val cnts = df1.groupBy($"k").sum()
仍然需要TungstenExchange
:
cnts.explain
// == Physical Plan ==
// TungstenAggregate(key=[k#90], functions=[(sum(v#91),mode=Final,isDistinct=false)], output=[k#90,sum(v)#93])
// +- TungstenExchange hashpartitioning(k#90,200), None
// +- TungstenAggregate(key=[k#90], functions=[(sum(v#91),mode=Partial,isDistinct=false)], output=[k#90,sum#99])
// +- Scan JSONRelation[k#90,v#91] InputPaths: file:/tmp/foo.json
bucketBy
中的 DataFrameWriter
方法(Spark&gt; = 2.0):
bucketBy
具有与partitionBy
类似的应用程序,但它仅适用于表格(saveAsTable
)。 Bucketing信息可用于优化连接:
// Temporarily disable broadcast joins
spark.conf.set("spark.sql.autoBroadcastJoinThreshold", -1)
df.write.bucketBy(42, "k").saveAsTable("df1")
val df2 = Seq(("A", -1.0), ("B", 2.0)).toDF("k", "v2")
df2.write.bucketBy(42, "k").saveAsTable("df2")
// == Physical Plan ==
// *Project [k#41, v#42, v2#47]
// +- *SortMergeJoin [k#41], [k#46], Inner
// :- *Sort [k#41 ASC NULLS FIRST], false, 0
// : +- *Project [k#41, v#42]
// : +- *Filter isnotnull(k#41)
// : +- *FileScan parquet default.df1[k#41,v#42] Batched: true, Format: Parquet, Location: InMemoryFileIndex[file:/spark-warehouse/df1], PartitionFilters: [], PushedFilters: [IsNotNull(k)], ReadSchema: struct<k:string,v:int>
// +- *Sort [k#46 ASC NULLS FIRST], false, 0
// +- *Project [k#46, v2#47]
// +- *Filter isnotnull(k#46)
// +- *FileScan parquet default.df2[k#46,v2#47] Batched: true, Format: Parquet, Location: InMemoryFileIndex[file:/spark-warehouse/df2], PartitionFilters: [], PushedFilters: [IsNotNull(k)], ReadSchema: struct<k:string,v2:double>
*通过分区布局我的意思是只有数据分发。 partitioned
RDD不再是分区程序。
**假设没有早期预测。如果聚合仅涵盖小的列子集,则可能无法获得任何收益。
答案 1 :(得分:11)
在Spark&lt; 1.6如果您创建了HiveContext
,而不是普通的SqlContext
,则可以使用HiveQL DISTRIBUTE BY colX...
(确保每个N缩减器获得x的非重叠范围)&amp;例如CLUSTER BY colX...
(分发依据和排序依据的快捷方式);
df.registerTempTable("partitionMe")
hiveCtx.sql("select * from partitionMe DISTRIBUTE BY accountId SORT BY accountId, date")
不确定这如何适用于Spark DF api。普通的SqlContext不支持这些关键字(注意你不需要有一个hive元存储来使用HiveContext)
编辑: Spark 1.6+现在在原生DataFrame API中有这个
答案 2 :(得分:7)
使用返回的DataFrame:
yourDF.orderBy(account)
没有明确的方法在DataFrame上使用partitionBy
,只能在PairRDD上使用,但是当您对DataFrame进行排序时,它会在其中使用LogicalPlan,这将在您需要时提供帮助对每个账户进行计算。
我偶然发现了同样的问题,我希望按帐户划分数据框。
我假设当你说'#34;想要对数据进行分区以便一个帐户的所有事务都在同一个Spark分区中时,你想要它的规模和性能,但你的代码并没有。依赖于它(比如使用mapPartitions()
等),对吧?
答案 3 :(得分:5)
我能够使用RDD完成此操作。但我不知道这是否是一个可以接受的解决方案。
将DF作为RDD提供后,您可以应用repartitionAndSortWithinPartitions
来执行数据的自定义重新分区。
以下是我使用的示例:
class DatePartitioner(partitions: Int) extends Partitioner {
override def getPartition(key: Any): Int = {
val start_time: Long = key.asInstanceOf[Long]
Objects.hash(Array(start_time)) % partitions
}
override def numPartitions: Int = partitions
}
myRDD
.repartitionAndSortWithinPartitions(new DatePartitioner(24))
.map { v => v._2 }
.toDF()
.write.mode(SaveMode.Overwrite)
答案 4 :(得分:4)
所以从某种答案开始:) - 你不能
我不是专家,但据我了解DataFrames,它们不等于rdd,而DataFrame没有Partitioner这样的东西。
一般来说,DataFrame的想法是提供另一个抽象级别来处理这些问题本身。 DataFrame上的查询被转换为逻辑计划,进一步转换为RDD上的操作。您建议的分区可能会自动应用,或者至少应该应用。
如果您不相信SparkSQL会提供某种最佳工作,您可以按照评论中的建议将DataFrame转换为RDD [Row]。