这是一个谜。我刚刚在我的Windows机器上安装了Cygwin（Windows 8）。我尝试的第一件事是git clone（我使用ssh克隆了一个私有存储库，而不是github上的任何东西）。它宣布克隆成blah-blah-blah，然后就冻结了。我等了几分钟，什么都没有。我查看了目录，并且使用.git子目录创建了一个目录，但没有别的。它从来没有要求我提供密码。
我能够从Windows命令提示符使用git，并且我从Git网站下载的git shell可以运行。所以我的git连接没问题。它只是Cygwin下的git。
如果我可以在Cygwin之外使用git，你可能会问为什么我很烦。这只是因为我正在尝试调试我编写的一些git钩子脚本，并且我希望它们可以被在Cygwin下使用git的人使用。但我甚至无法达到调用git钩子的程度。
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我对此没有任何进一步的了解。我不再将Cywin用于git，而是一直在使用git bash shell
我通常会确保使用separate PATH when using cygwin。
如果使用Git，请确保引用一个simplified PATH。
在这两种情况下，您都需要确保$HOME引用正确的文件夹，因为凭据可以默认存储在其中（例如，对于您的SSH密钥，~/.ssh）