Bash：转换4列文本交错行（制表符分隔列到FASTQ文件）

Question

我需要将每个条目的4列文件转换为4行。该文件以制表符分隔。

当前文件按以下格式排列，每行代表一条记录/序列（有数百万条这样的行）：

@SRR1012345.1   NCAATATCGTGG    #4=DDFFFHDHH    HWI-ST823:136:C24YTACXX
@SRR1012346.1   GATTACAGATCT    #4=DDFFFHDHH    HWI-ST823:136:C22YTAGXX

我需要重新排列这个，以便将四列显示为4行：

@SRR1012345.1
NCAATATCGTGG
#4=DDFFFHDHH
HWI-ST823:136:C24YTACXX
@SRR1012346.1
GATTACAGATCT
#4=DDFFFHDHH
HWI-ST823:136:C22YTAGXX

最好的方法是做什么，最好是用bash one-liner？谢谢你的帮助！

Answer 1

您可以使用tr：

< file tr '\t' '\n' > newfile

Answer 2

非常清楚在这里使用awk：

awk '{print $1; print $2; print $3; print $4}' file

Answer 3

$ awk -v OFS='\n' '{$1=$1}1' file
@SRR1012345.1
NCAATATCGTGG
#4=DDFFFHDHH
HWI-ST823:136:C24YTACXX
@SRR1012346.1
GATTACAGATCT
#4=DDFFFHDHH
HWI-ST823:136:C22YTAGXX