Question

我是新来的，我需要帮助处理一些我一直在努力的代码，因为我已经迷失了自己，现在只是感到困惑。

首先，我根据本网站的一些帮助创建了一个字典。我的字典样本如下：

length = {'A': [(0,21), (30,41), (70,80)] 'B': [(0,42), (70,80)]..etc}

我有一个文件，我想用它来迭代包含这些信息的词典：

A    32
B    15
etc

我想要做的是获取文件中的第一个功能，并将其与我的字典中的键匹配。一旦我匹配，我想看看我的文件中的数字与哪个范围匹配。例如，我的文件中的第一个功能将匹配A和第二个范围。这意味着我希望我的输出显示名称（A）和显示2，因为它匹配第二个范围。

我已尝试过以下代码：

import csv
with open('Exome_agg_cons_snps_pct_RefSeq_HGMD_reinitialized.txt') as f:
    reader = csv.DictReader(f,delimiter="\t")
    for row in reader:
        snppos = row['snp_rein']
        name = row['isoform']
        snpos = int(snppos)
        if name in exons:
            y = exons[name]
            if y[0] <= snpos <=y[1]:
                print name,snppos

然而，这并没有给我任何输出。我不确定我的代码有什么问题。我是新人。我想我可能会遗漏一些东西。此外，我意识到我的代码不会做我想做的事情（告诉我它匹配的范围）。我正在考虑使用.index()函数，但我不确定我能否使用它。有什么建议吗？

Answer 1

您只需要在dict值中循环跨越。让for-loop分裂它们会更好：

for row in reader:
    snppos = row['snp_rein']
    name = row['isoform']
    if name in exons:
        for low, high in exons[name]:
             if low <= snppos <= high:
                 print name, low, high
                 break    # Since exons can't overlap, go to next row immediately

如果您需要外显子列表中的索引而不是跨度（例如，索引2而不是(70, 80)），则添加enumerate：

    ...
        for i, (low, high) in enumerate(exons[name]):
             if low <= snppos <= high:
                 print name, i
                 break

Answer 2

如果您的词典中的列表已经订购，那么此方法将起作用

enumerate方法提供两个输出，一个是索引，下一个是值。
由于这里的值是list，我们正在遍历列表[一次一个列表]。
我们使用max方法查找列表的最大值
然后我们将它与文本中的值进行比较。
如果是这样，我们将打印索引+1和名称

代码：

for sd, i  in enumerate(exons[name]):
    if snpos<=max(i) and snpos>=min(i):
        print sd+1,name
        break

确定给定字典的位置，列表中包含列表

2 个答案: