我正在为Web数据库上的多个请求做一个循环,每次需要一个geneId来请求它到数据库。如果引用了geneId,我可以将我获得的数据用于第二个数据库上的另一个请求。但是如果没有引用geneId,它就不会给我任何回报,它会破坏我的功能。 所以我确定了无可能性,但在这种情况下,我得到了一个:
TypeError: 'NoneType' object is not iterable.
这是我的代码的一部分,其中包含None:
def getNewID(oneGeneIdAtOnce):
url = "http:/blablabla"
try :
cookieJar = http.cookiejar.CookieJar()
opener = urllib.request.build_opener(urllib.request.HTTPCookieProcessor(cookieJar))
opener.addheaders = getHeaders()
resp = opener.open(url)
data = urllib.parse.urlencode(getPost(oneGeneIdAtOnce))
data = data.encode("UTF-8")
resp = opener.open(url, data)
respData = resp.read()
jobValue = getJobValueFromCookie(cookieJar)
downloadUrl = getUrlFromJobValue(jobValue)
resp = opener.open(downloadUrl)
respData = resp.read()
string = respData.decode("UTF-8")
if not string:
return None
l = string.split("\n")
lFinal = l[1].split("\t")
return lFinal[1]
except HTTPError as httpError:
print("HERE " + str(httpError))
except TypeError:
None
def searchGoFromDico(dictionary):
dicoGoForEachGroup = {}
for groupName in dico:
taxonAndGene = dico[groupName]
listeAllGoForOneGroup = []
for taxon in taxonAndGene:
geneIds = taxonAndGene[taxon]
for geneId in geneIds:
if geneId is not None:
listeGo = getGoID(getUniprotID(geneId))
listeAllGoForOneGroup.extend(listeGo)
dicoGoForEachGroup[groupName] = listeAllGoForOneGroup
return dicoGoForEachGroup
任何想法都允许我的函数正常工作,即使其中一个geneId对于数据库是None?感谢您即将获得的答案。
答案 0 :(得分:0)
您可以在导致问题的代码周围使用try / except块。如果列表为空,则运行外部for循环的下一次迭代(未测试):
def searchGoFromDico(dictionary):
dicoGoForEachGroup = {}
for groupName in dico:
taxonAndGene = dico[groupName]
listeAllGoForOneGroup = []
for taxon in taxonAndGene:
geneIds = taxonAndGene[taxon]
try:
for geneId in geneIds:
if geneId is not None:
listeGo = getGoID(getUniprotID(geneId))
listeAllGoForOneGroup.extend(listeGo)
except TypeError:
continue
dicoGoForEachGroup[groupName] = listeAllGoForOneGroup
return dicoGoForEachGroup