期望脚本中的“无效命令”错误在交互模式下很好

时间:2015-06-15 00:07:27

标签: linux shell

我在运行expect脚本时遇到了问题(在此非常新)。 以下是我现在在期望脚本autorun.exp中的内容:

#!/usr/bin/expect -f
cd /auto/rmscr/shared_resources/qiuyuguo/softwares/QuEST_2.4
./generate_QuEST_parameters.pl -sam_align_ChIP A.sam -sam_align_RX_noIP \
    B.sam -rp mm10_bychr -ap ./output_directory -ChIP_name name

运行此脚本后,我得到的是:

[qiuyuguo@hpc-uec 20150605]$ ./auto_run.exp
invalid command name "./generate_QuEST_parameters.pl"
    while executing
"./generate_QuEST_parameters.pl -sam_align_ChIP A.sam -s..."
    (file "./auto_run.exp" line 3)

有趣的是,脚本中的内容在期望的交互模式下运行良好。我可以得到关于发生了什么的暗示吗?

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