我有一个60.000 obs / 40 Variable数据集,我使用了Clara,主要是由于内存限制。
library(cluster)
library(dplyr)
mutate(kddnew, Att=ifelse(Class=="normal","normal", "attack"))
ds <- dat[,c(-20,-21,-40)
clus <- clara(ds, 3, samples=500, sampsize=100, pamLike=TRUE)
这返回了一个带有medoids的表。
现在我正在尝试使用knn
进行这样的预测:
medoidz <- clus$medoids
r <- knn(medoidz, ds, cl=ds$targetvariable)
它返回
'train'和'class'有不同的长度
有人可以说明如何使用它吗?
答案 0 :(得分:4)
这有效:
require(cluster)
require(class)
data(iris)
ds <- iris
ds$y <- as.numeric(ds$Species)
ds$Species <- NULL
idx <- rbinom(nrow(ds), 2, .6)
training <- ds[idx,]
testing <- ds[-idx,]
x <- training
y <- training$y
x1 <- testing
y1 <- testing$y
clus <- clara(x, 3, samples = 1, sampsize = nrow(x), pamLike=TRUE)
knn(train = x, test = x1, cl = clus$clustering, k = 10, l = 0, prob = T, use.all = T)
虽然3对于此数据集中的聚类数量来说显然是一个糟糕的选择,但预测并不好。希望您为数据选择正确数量的聚类,然后使用prediction.strength
包中的fpc
或其他方式测试预测强度。