对RDD元素进行排序

时间:2015-06-09 02:52:38

标签: sorting apache-spark rdd

对于研究项目,我尝试在RDD中对元素进行排序。我用两种不同的方法做到了这一点。

在第一种方法中,我在RDD上应用了mapPartitions()函数,以便它对RDD的内容进行排序,并提供包含排序列表作为RDD中唯一记录的结果RDD。然后,我应用了一个基本上合并排序列表的reduce函数。

我在包含30个节点的EC2群集上运行这些实验。我使用spark ec2脚本进行设置。数据文件存储在HDFS中。

在第二种方法中,我在Spark中使用了sortBy方法。

我在美国人口普查数据(100MB)here

上执行了这些操作

单行看起来像这样

9, Not in universe, 0, 0, Children, 0, Not in universe, Never married, Not in universe or children, Not in universe, White, All other, Female, Not in universe, Not in universe, Children or Armed Forces, 0, 0, 0, Nonfiler, Not in universe, Not in universe, Child <18 never marr not in subfamily, Child under 18 never married, 1758.14, Nonmover, Nonmover, Nonmover, Yes, Not in universe, 0, Both parents present, United-States, United-States, United-States, Native- Born in the United States, 0, Not in universe, 0, 0, 94, - 50000.

我根据CSV中的第25个值进行排序。在这一行是1758.14。

我注意到sortBy的表现比其他方法差。这是预期的情况吗?如果是,为什么mapPartitions()和reduce()不是默认的排序方法?

这是我的实施

public static void sortBy(JavaSparkContext sc){
        JavaRDD<String> rdd = sc.textFile("/data.txt",32);
        long start = System.currentTimeMillis();
        rdd.sortBy(new Function<String, Double>(){

            @Override
                public Double call(String v1) throws Exception {
                      // TODO Auto-generated method stub
                  String [] arr = v1.split(",");
                  return Double.parseDouble(arr[24]);   
                }
        }, true, 9).collect();
        long end = System.currentTimeMillis();
        System.out.println("SortBy: " + (end - start));
  }

public static void sortList(JavaSparkContext sc){
        JavaRDD<String> rdd = sc.textFile("/data.txt",32); //parallelize(l, 8);
        long start = System.currentTimeMillis();
        JavaRDD<LinkedList<Tuple2<Double, String>>> rdd3 = rdd.mapPartitions(new FlatMapFunction<Iterator<String>, LinkedList<Tuple2<Double, String>>>(){

        @Override
        public Iterable<LinkedList<Tuple2<Double, String>>> call(Iterator<String> t)
            throws Exception {
          // TODO Auto-generated method stub
          LinkedList<Tuple2<Double, String>> lines = new LinkedList<Tuple2<Double, String>>();
          while(t.hasNext()){       
            String s = t.next();
            String arr1[] = s.split(",");
            Tuple2<Double, String> t1 = new Tuple2<Double, String>(Double.parseDouble(arr1[24]),s);
            lines.add(t1);
          }
          Collections.sort(lines, new IncomeComparator());
          LinkedList<LinkedList<Tuple2<Double, String>>> list = new LinkedList<LinkedList<Tuple2<Double, String>>>();
          list.add(lines);
          return list;
        }

        });
        rdd3.reduce(new Function2<LinkedList<Tuple2<Double, String>>, LinkedList<Tuple2<Double, String>>, LinkedList<Tuple2<Double, String>>>(){

        @Override
        public LinkedList<Tuple2<Double, String>> call(
                LinkedList<Tuple2<Double, String>> a,
                LinkedList<Tuple2<Double, String>> b) throws Exception {
          // TODO Auto-generated method stub
          LinkedList<Tuple2<Double, String>> result = new LinkedList<Tuple2<Double, String>>();
          while (a.size() > 0 && b.size() > 0) {

            if (a.getFirst()._1.compareTo(b.getFirst()._1) <= 0)
              result.add(a.poll());
            else
              result.add(b.poll());
          }

          while (a.size() > 0)
            result.add(a.poll());

          while (b.size() > 0)
            result.add(b.poll());

          return result;

        }

        });     
        long end = System.currentTimeMillis();
        System.out.println("MapPartitions: " + (end - start));
  }

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

Collect()是一个主要的瓶颈,因为它会将所有结果返回给驾驶员 它产生了IO hit&amp;额外的网络流量到单个源(在这种情况下 - 驱动程序) 它还会阻止其他操作。

而不是第一个sortBy()代码段中的collect(), 尝试执行saveAsTextFile(tmp)之类的并行操作,而不是使用sc.textFile(tmp)进行回读。

另一个sortBy()代码段同时使用mapPartitions()和reduce()并行API - 因此整个工作是并行完成的。
这似乎是造成端到端性能时间差异的原因。

请注意,您的发现并不一定意味着所有计算机上的执行时间总和更糟。

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