共享库显然不包含任何例程

Question

我试图建立C++ library Faddeeva的R接口（各种类型的复杂错误函数）;不幸的是，我在R中调用外部代码的经验很少，而且它证明是一个很大的挑战。

我天真的尝试，

R CMD SHLIB Faddeeva.cc

生成了一个共享库Faddeeva.so，我在R中加载

dyn.load("Faddeeva.so")
dlls <- getLoadedDLLs()
getDLLRegisteredRoutines(dlls[['Faddeeva']])

它是空的，我还没有注册任何功能。我相信我必须编写一些接口代码才能使用SEXP，以便我可以使用.Call接口（Rcpp可以让这一步更容易吗？），但是我仍然对这个共享库的原因感到困惑显示没有注册的例程。

欢迎任何有关进行此类项目的建议或指示！

编辑：感谢Dirk对Rcpp的回答和帮助，现在该界面已在Faddeeva package中实现。

Answer 1

我会退一步看看使用外部库的其他软件包。 oldie但goldie是RcppGSL，但是例如RcppRedis使用（C库）hiredis。

真的没有深刻的魔力：

1. 使用其他库中的头文件来声明标识符
2. 编写一个简短的C ++文件来部署其中一个标识符
3. 通过$em->persist($item); $em->flush($item); 将ldconfig -p | grep libraryname添加到src/Makevars，链接到其他库（应该在您的系统上可见 - 在Linux上PKG_LIBS）。
4. 或者，如果您在包装中填写Johnson's Fadeeva的来源，只需将文件包含在src/中并跳过第3步。

请注意，我对Rcpp一无所知。它“仅”帮助第2点。其余部分与将C库链接到R扩展名相同。这可能是CRAN上的一千个不同包。

如果您完全迷失了，请考虑the new list r-package-devel，但请先在Writing R Extensions中阅读一下。

Jelmer的包裹nloptr包裹了约翰逊的另一个图书馆：nlopt。也许这可以作为灵感来帮助。我帮助了一点，使安装更有效率（通过使用系统libnlopt）。

编辑：我仔细查看了page by Johnson。没有图书馆。只需.cc和.hh。将这些内容放入您的软件包的src/，可能会重命名为.cpp和.h - 您就完成了！

编辑2：好的，我根据我刚才概述的食谱创建了一个小样本包。通过使用Rcpp，调用者变得像

一样简单

#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;

#include "Faddeeva.h"

// [[Rcpp::export]]
double Dawson(double x) { // special case for real x
  return Faddeeva::Dawson(x);
}

我们可以像往常一样使用这个包：

edd@max:/tmp$ Rscript -e 'library(RcppFaddeeva); Dawson(4.2)'
[1] 0.122761
edd@max:/tmp$ 

我马上把它放在GitHub上。

编辑3：现在是in this GitHub repo。