我正在寻找在我的数据集中执行网络分析的解决方案。
我的数据库形状如下:
Table 1 :
Species a | Species b | Species c | Species x |
Relevé 1| NA 2 2 4
Relevé 2| 3 NA 1 1
Relevé 3| 1 2 5 NA
Relevé x| 5 1 1 NA
在第一列中是相关ID(对于每个采样的图表是唯一的),并且在行中覆盖丰富的物种(如果在图中看到),或者NA(如果没有看到的话)。
从这个数据库中我会得到一个表格,它可以让我分析每个物种之间的链接,如:
Species1 | Species2 | Strenth (number of time the link exists)
示例(根据表1):
Species a | Species b | 2
Species a | Species c | 3
Species a | Species x | 1
Species b | Species a | 2
Species b | Species c | 3
Species b | Species x | 1
Species c | Species a | 3
Species c | Species b | 3
Species c | Species x | 2
...
如果物种之间的联系在至少一个相关物中共存,则认为物种之间的联系是真实的。
如果有人知道该怎么做,那会很有帮助!
修改
另一个有用的解决方案是:
Species a | Species b | Species c | Species x |
Species a| 0 2 3 1
Species b| 2 0 3 1
Species c| 3 3 0 2
Species x| 1 1 2 0
此数据框中的结果与表1 ...
相关联有什么想法吗?