与knitr垂直堆叠的子图

Question

我试图在Latex文档中使用knitr将两个子图层垂直堆叠而不是并排堆叠。在乳胶中，我通常通过放置一个＆＃39; \ par＆＃39;两个子浮点之间的命令需要叠加在一起，但我不知道如何将该命令传递给knitr。

我只能在此找到一个主题Subfigures or Subcaptions with knitr?。 Yihui给出的例子将这些数字并排放置。该线程中的最终答案实现了我的目标，但是使用了相当多的黑客攻击，所以我想知道是否有一种简单的方法可以直接将此命令传递给knitr？

MWE：

\documentclass[a4paper]{article} 

\usepackage[font=footnotesize]{subfig}

\begin{document} 

<<GeneratePlot>>=
library(ggplot2)
library(tikzDevice)
P1 <- ggplot(data=mpg, aes(x=displ, y=hwy, colour=factor(cyl)))+
    geom_line()
P2 <-  ggplot(data=mpg, aes(x=displ, y=hwy, colour=factor(cyl)))+
    geom_point()
@


<<fig1,eval=TRUE,echo=FALSE,dev='tikz', fig.width=6, fig.height=3, out.width='1\\textwidth', fig.cap='Two figures', fig.subcap=c('Top','Bottom'), fig.show='asis', fig.pos='!htpb', fig.align='center', dependson='GeneratePlot'>>= 
P1
P2
@ 

\end{document}

我也尝试在与输出相同的块中创建绘图对象，但是产生相同的结果，并且在我的原始文档中，绘图对象是作为更大块的一部分生成的，因此它将具有与MWE相同的结构。

Answer 1

您可以使用非CRAN软件包oaReporting执行此操作。

\documentclass[a4paper]{article} 
\usepackage{float}
\usepackage{subcaption}

\begin{document} 

<<setup, include=FALSE>>=
knitr::opts_chunk$set(fig.path="figures/")
library(oaReporting)
@

<<GeneratePlot>>=
library(ggplot2)
P1 <- ggplot(data=mpg, aes(x=displ, y=hwy, colour=factor(cyl)))+
    geom_line()
P2 <-  ggplot(data=mpg, aes(x=displ, y=hwy, colour=factor(cyl)))+
    geom_point()
path1 <- createPlot(P1, file="./figures/P1.pdf")
path2 <- createPlot(P2, file="./figures/P2.pdf")
captions <- c("P1", "P2")
@

<<results="asis", fig.keep="none">>=
insertFigures(paths = c(path1, path2), captions=captions,
              generalCaption = "P1 and P2",
              generalLabel = "fig:P1andP2",
              posMultipleFig = "H",
              nCol = 1, 
              width = 0.7)
@

\end{document}

Answer 2

knitr 1.17.19（officially supported）中的current on Github。要在两个子图片之间添加\par，您可以使用块选项fig.sep = '\\par'，例如，

\documentclass[a4paper]{article}

\usepackage[font=footnotesize]{subfig}

\begin{document}

<<GeneratePlot>>=
library(ggplot2)
library(tikzDevice)
P1 <- ggplot(data=mpg, aes(x=displ, y=hwy, colour=factor(cyl)))+
    geom_line()
P2 <-  ggplot(data=mpg, aes(x=displ, y=hwy, colour=factor(cyl)))+
    geom_point()
@


<<fig1, echo=FALSE,dev='tikz', fig.width=6, fig.height=3, out.width='1\\textwidth', fig.cap='Two figures', fig.subcap=c('Top','Bottom'), fig.show='asis', fig.pos='!htpb', fig.sep='\\par'>>=
P1
P2
@

\end{document}

输出：