MPI发送带有字节数组和整数的结构

时间:2015-06-05 08:16:49

标签: c++ opencv struct mpi mat

我想将图像数据(无符号字符数组),宽度和高度从0级发送到1级。这样做的最佳方法是什么?我已经读过,要在MPI中发送复杂的数据结构,我们可以使用打包数据或创建自己的数据类型。在我的情况下哪个更好?

我尝试通过创建新数据类型来做到这一点。但我有错:Segmentation fault (signal 11)。当我从我的结构中删除数组时它是有效的。那么发送这个数组有什么问题呢?

我的结构:

typedef struct MyImage {
    int w;
    int h;
    unsigned char *data;
} image;

主:

int main(int argc, char **argv) {

    int size, rank;
    MPI_Init(&argc, &argv);
    MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);

    int blocksCount = 3;
    int blocksLength[3] = {1, 1, 512 * 512 * 3};

    //   I also tried MPI_BYTE
    MPI_Datatype types[3] = {MPI_INT, MPI_INT, MPI_UNSIGNED_CHAR};
    MPI_Aint offsets[3];
    MPI_Datatype custom_type;
    offsets[0] = offsetof(image, w);
    offsets[1] = offsetof(image, h);
    offsets[3] = offsetof(image, data);

    MPI_Type_create_struct(blocksCount, blocksLength, offsets, types, &custom_type);
    MPI_Type_commit(&custom_type);

    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
    if (rank == 0) {

    Mat mat = imread("/home/user/image.jpg", CV_LOAD_IMAGE_COLOR);
        image send;
        send.w = mat.size().width;
        send.h = mat.size().height;
        send.data = mat.data;
        MPI_Send(&send, 1, custom_type, 1, 0, MPI_COMM_WORLD);
    }
    if (rank == 1) {
        image recv;
        MPI_Status status;
        MPI_Recv(&recv, 1, custom_type, 0, MPI_ANY_TAG, MPI_COMM_WORLD, &status);
    }
    MPI_Type_free(&custom_type);
    MPI_Finalize();

    return 0;
}

1 个答案:

答案 0 :(得分:4)

发件人段错误,因为您尝试从Mat.data指针本身的位置开始发送数据,而不是从内存中指向的位置发送数据。接收器段错误,因为没有空间存储768 KiB数据(如果有任何数据到达)。

您可以先打包数据,但这需要额外的缓冲区。您最好的选择就是发送两条消息:

  • 具有图像大小的一个,以便接收者可以准备适当大小的Mat对象;
  • 一个带有图像数据本身。

有时发送两条消息而不是将所有内容打包成一条消息会更好。

typedef struct MyImage {
   int w;
   int h;
} image;

int blocksCount = 2;
int blocksLength[2] = {1, 1};

MPI_Datatype types[2] = {MPI_INT, MPI_INT};
MPI_Aint offsets[2];
MPI_Datatype custom_type;
offsets[0] = offsetof(image, w);
offsets[1] = offsetof(image, h);

MPI_Type_create_struct(blocksCount, blocksLength, offsets, types, &custom_type);
MPI_Type_commit(&custom_type);

if (rank == 0) {
    Mat mat = imread("/home/user/image.jpg", CV_LOAD_IMAGE_COLOR);
    image send;
    send.w = mat.size().width;
    send.h = mat.size().height;
    // Send image dimensions
    MPI_Send(&send, 1, custom_type, 1, 0, MPI_COMM_WORLD);
    // Send image data
    MPI_Send(mat.data, send.w*send.h*3, MPI_UNSIGNED_CHAR, 1, 0, MPI_COMM_WORLD);
}
if (rank == 1) {
    image recv;
    MPI_Status status;
    // Receive image dimensions
    MPI_Recv(&recv, 1, custom_type, 0, 0, MPI_COMM_WORLD, &status);
    // Allocate image matrix
    Mat mat(Size(recv.w, recv.h), CV_8UC3);
    // Receive image data
    MPI_Recv(mat.data, recv.w*recv.h*3, MPI_UNSIGNED_CHAR, 0, 0, MPI_COMM_WORLD, &status);
    ...
}