Question

rarecurve（）（menuButton.addTarget(self.revealViewController(), action: "revealToggle:", forControlEvents: UIControlEvents.TouchUpInside)）是否接受绘图的标准错误？

如果是这样，我该如何绘制这样一条曲线？

我正在遵循一个经典的脚本，使用BCI数据集：

vegan

从统计学角度讲，促进这一功能对大多数S <- specnumber(BCI) (raremax <- min(rowSums(BCI))) Srare <- rarefy(BCI, raremax) plot(S, Srare, xlab = "Observed No. of Species", ylab = "Rarefied No. of Species") abline(0, 1) rarecurve(BCI, step = 20, sample = raremax, col = "blue", cex = 0.6)用户都有帮助。

谢谢！安德烈

Answer 1

rarecurve没有给你SE。原因很明显，已经给你了：没有额外的曲线就有足够的杂乱。如果你真的想这样做，你必须手动完成。这并不太复杂，因为rarefy函数接受矢量样本大小并为您提供所需的所有数字。下面使用Barro Colorado数据集的一个站点绘制基本图：

library(vegan)
data(BCI)
sum(BCI[1,]) # site 1, 448 tree stems
N <- seq(2, 448, by=8)
S <- rarefy(BCI[1,], N, se = TRUE)
plot(N, S[1,], type="l", lwd=3)
lines(N, S[1,] + 2*S[2,]) ## 2*SE is good enough for 95% CI
lines(N, S[1,] - 2*S[2,])

从统计学上讲，这只给出了由子采样过程引起的误差，假设观察到的数据没有随机变化。对我来说这没有多大意义，我发现稀有的SE是误导性和无意义的。这并不能阻止我在素食主义者中提供它们。

用标准误差绘制的rarecurve（）

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