如何将表条目与R中的第二个表的列表条目进行匹配?

时间:2015-06-04 18:53:49

标签: r loops for-loop grepl

我有两个表,table1有一列字符串。我想在另一个表table2中找到每个字符串的匹配项,但在相应的table2列中,每个单元格包含每行条目的列表。

到目前为止,我已经找到了如何使用grepl来匹配特定条目:

grepl(table1$label[i],table2$labels[[j]][k])

对于某些i,j和k。 i和j是固定的,因为它们分别是表1和表2中的行数,但k是一些正值,所以我有这样的东西:

for (i in 1:nrow(table1)){
  for (j in 1:nrow(table2){
    for(k ?){
    grepl(table1$label[i],table2$labels[[j]][k])
    }
  }
}

我不确定要为k循环放什么。

一旦我确定了包含table1字符串的table2行,我想要做的是从不同的table2列报告相应的值并将它们追加到table1中相应的字符串行,所以我'我猜我还需要更多的循环...是否有任何快捷方式可以解决多个引用问题?

一些示例数据(请注意,table2列表中也缺少值,但我假设在匹配这些值时会被忽略,其他条目是字符类):

表1

    label 
1   Tom     
2   Gemma     
3   Graham     

表2(更新)

     item      labels 
1    Apple     Tom, ,John, ,Terry,     
2    Orange    Bryan, ,Graham,  
3    Pear      Finn, ,Gemma, ,Graham, 

输出

表1

    label   item
1   Tom     Apple
2   Gemma   Pear  
3   Graham  Orange, Pear

从使用dput我得到

Table1 <- structure(list(label = c("Tom", "Gemma", "Graham")), .Names = "label", 
class = "data.frame", row.names = c(NA, 
-3L))


Table2 <- structure(list(item = c("Apple", "Orange", "Pear"), labels = list(
    structure(c("Tom", "", "John", "", "Terry", ""), .Dim = c(6L, 
    1L)), structure(c("Bryan", "", "Graham", ""), .Dim = c(4L, 
    1L)), structure(c("Finn", "", "Gemma", "", "Graham", ""), .Dim = c(6L, 
    1L)))), .Names = c("item", "labels"), row.names = c(NA, -3L
), class = "data.frame")

附录:关于我最初使用grepl,表2中的某些标签只与Table1中的标签部分匹配,但名称在表1中是唯一的,所以我想应用匹配表1标签,例如Graham(表1)到Graham(表2)和Graham Green(表2),例如

表2(第2版)

     item      labels 
1    Apple     Tom, ,John, ,Terry,     
2    Orange    Bryan, ,Graham,  
3    Pear      Finn, ,Gemma, ,Graham Green, 

输出Table1将是相同的。

2 个答案:

答案 0 :(得分:4)

以下是使用data.table

的尝试
library(data.table)
res <- setDT(Table2)[, list(label = unlist(labels)), by = item]
setkey(res, label)[Table1, toString(unique(item)), by = .EACHI]
#     label         item
# 1:    Tom        Apple
# 2:  Gemma         Pear
# 3: Graham Orange, Pear

我在这里基本上做的是每个项目labels分割Table2。然后,我将每个标签的唯一项目聚合在一起,同时执行二元左连接回Table1

您可以将代码修改为

的新Table2

修改

res <- setDT(Table2)[, list(label = unlist(labels)), by = item]
Table1["item"] <- sapply(Table1$label, function(x) toString(unique(res[grepl(x, label), item])))
Table1
#    label         item
# 1    Tom        Apple
# 2  Gemma         Pear
# 3 Graham Orange, Pear

答案 1 :(得分:1)

这是 qdapTools 方法,它在后端使用 data.table 。您的数据类型有点模棱两可。 dput在这里会有所帮助。

我认为您的数据基于NA评论

Table1 <- read.table(text="   label 
1   Tom     
2   Gemma     
3   Graham", header=TRUE)


key <- list(
    Apple  = c('Tom', NA, 'John', NA, 'Terry'),
    Orange =  c('Bryan', 'Graham'),
    Pear =  c('Finn', 'Gemma', NA, 'Graham')
)

现在查找值:

library(qdapTools)
Table1[["item"]] <- lapply(Table1[[1]], lookup, key)

##    label         item
## 1    Tom        Apple
## 2  Gemma         Pear
## 3 Graham Orange, Pear

如果您有data.frame,请尝试:

key2 <- data.frame(x = names(key))
key2[["item"]] <- key

Table1[["item2"]] <- lapply(Table1[[1]], lookup, setNames(as.list(key2[[2]]), key2[[1]]))

如果列确实是折叠/粘贴的矢量:

key2 <- data.frame(x = names(key))
key2[["item"]] <- lapply(key, paste, collapse=", ")
Table1[["item2"]] <- lapply(Table1[[1]], lookup, setNames(strsplit(as.character(key2[[2]]), "\\s*,\\s*"), key2[[1]]))