Question

我正在开发一个Java项目，并且因为它没有显示任何结果而停留在一个步骤。

java代码是：

public class callPgs {

public static void main(String[] args) {
    // TODO Auto-generated method stub

    try{    
        Process p = Runtime.getRuntime().exec("C:/R/R-3.2.0/bin/Rscript.exe C:/R/R-3.2.0/bin/arrayqualityMetrics.R");

        int processComplete = p.waitFor();

                   if (processComplete == 0) {

                        JOptionPane.showMessageDialog(null,"Process is completed");
                        System.out.println("successfull");
                   } else {
                       JOptionPane.showMessageDialog(null,"You Have selected Wrong Input File");
                        System.out.println("Could not complete");
                   }
                }
                catch (Exception e1)
                {
                               e1.printStackTrace();
                }
    }

}

因为我使用Rscript.exe

使用命令提示符执行此操作

C:\R\...\bin\Rscript "arrayqualityMetrics.R"

我正确地得到了我的结果但是当我使用上面的代码通过Java netbeans进行它时，它在netbean的控制台中显示了“无法完成”的else选项。

由于其他RScripts运行良好且没有任何错误但是这个没有给出结果，因为Rscript是针对arrayqualityMetrics的： -

库（arrayQualityMetrics）

库（LIMMA）

库（tcltk）

options（warn = -1）#commands用于在从R控制台运行Rscript时删除警告。

X＆lt; -tk_choose.files（caption =“选择文件”）

maData＆lt; -read.maimages（X，source =“agilent”，other.columns =“gProcessedSignal”，green.only = TRUE）

eSet＆lt; -new（“ExpressionSet”，exprs = maData $ other $ gProcessedSignal，annotation = maData $ genes [，7]）

arrayQualityMetrics（eSet，outdir =“QC_C”，force = TRUE，do.logtransform = TRUE）

所以我想问天气Rscript中有任何错误，或者我应该在java代码中添加任何正确运行它的东西.... 任何帮助都很明显......

Answer 1

除非您连接到进程输入流，否则您将无法捕获它。

见

http://docs.oracle.com/javase/7/docs/api/java/lang/Process.html#getInputStream()

，如

 InputStream os = p.getInputStream ();
 while ((b = os.read ()) != -1) {
    System.out.print (b);
 }

Answer 2

您需要waitFor Process才能完成。根据Javadoc，导致当前线程在必要时等待，直到此Process对象表示的进程终止。此外，您可能希望为此添加一个catch可能InterruptedException。所以，像

try {
    Process p = Runtime.getRuntime().exec(
            "C:/R/R-3.2.0/bin/Rscript.exe my_script.R");
    p.waitFor();
} catch (IOException e) {
    e.printStackTrace();
} catch (InterruptedException e) {
    e.printStackTrace();
}

Answer 3

你可以这样做：

try{    
        Process p = Runtime.getRuntime().exec("C:\\R\\R-3.2.0\\bin\\Rscript.exe C:\\dir\my_script.R");

        int processComplete = p.waitFor();

           if (processComplete == 0) {
                System.out.println("successfull");
           } else {
                System.out.println("Could not complete");
           }
        }
        catch (Exception e)
        {
            e.printStackTrace();
        }
    }

尝试添加需要执行的文件的完整路径。我尝试过这个简单的例子，对我来说很好。

Process process = Runtime.getRuntime().exec("notepad C:\\abc.txt");

从java netbeans

3 个答案: