Question

使用R 3.2.x（RStudio 0.99.441）在mac 10.10.3上安装statnet。

ld: warning: directory not found for option '-L/usr/local/lib/gcc/x86_64-apple-darwin13.0.0/4.8.2'
ld: library not found for -lgfortran
clang: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)
make: *** [latentnet.so] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘latentnet’
* removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/latentnet’
Warning in install.packages :
installation of package ‘latentnet’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘latentnet’ is not available for package ‘statnet’
* removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources/library/statnet’
Warning in install.packages :
installation of package ‘statnet’ had non-zero exit status

我尝试更新XCode /命令行工具。还尝试不安装依赖项。我已经能够安装其他软件包，例如ergm和sna。

看起来安装正在寻找GCC文件夹而没有找到它。

whereis gcc

显示我的gcc位于/ usr / bin / gcc

看起来安装正在/ usr / local / lib / gcc /

中查找

有没有办法解决这个问题？

Answer 1

如果您尝试从源安装软件包，或者软件包需要从源代码编译库，那么这是一个编译错误。通常，如果您不使用最新版本的R，则可以从二进制文件安装statnet，因此R不必编译源包。

您在邮件开头提到的版本（0.99.441）是R-Studio的版本，而不是R.您的R的版本是3.2.x（因此它在Library文件夹中的地址： /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.2/Resources…）。在尝试修复编译错误之前，您可能希望尝试将R回滚到3.1.2或3.1.3之类的版本，您可以在其中下载并以二进制格式安装statnet。

对于编译器，我的猜测是即使你用符号链接修复你的gcc的地址，你仍然会得到关于gfortran或gcc版本的错误。一旦我通过Homebrew安装R和正确版本的gcc解决了这个问题，但是现在我没有可能尝试解决方案并告诉你究竟如何。

我的经验（在优胜美地）是如果使用3.1.2或3.1.3，即使需要编译，也不会出现gcc错误。

Answer 2

sudo mkdir /usr/bin/lib && sudo ln -s /usr/bin/gcc /usr/bin/lib/gcc

在/ usr / bin中创建一个名为`lib'的新目录，并在该新目录中创建一个指向gcc的符号链接。

如果这不能解决错误，您可以使用以下方法撤消错误：

sudo rm -i /usr/bin/lib/gcc && sudo rm -id /usr/bin/lib

安装Statnet包时出现gcc错误

2 个答案: