在Travis CI中安装Numpy 1.8

时间:2015-06-02 06:11:58

标签: python ubuntu numpy matplotlib travis-ci

在我的项目中,我(必须)使用Numpy 1.8中包含的功能,但不是早期版本(formatter的{​​{1}}选项)。

由于Travis CI构建机器基于Ubuntu 12.04,默认情况下我只有Numpy 1.6.1可用。然后我尝试为Ubuntu 14.04安装Numpy-1.8.1-Debian-package并手动依赖它,这导致了进一步的问题:

我需要安装软件包numpy.set_printoptionslibblas3才能安装Numpy 1.8,这在系统上安装liblapack3liblapack3gf时是不可能的(这是默认的),因为包会“破坏”它们。如果我libblas3gf他们,自动 apt-get remove正在通过相同的libatlas3gf-base - 命令安装(在标准的Ubuntu系统上不是这种情况,我甚至设置了一个在我的本地机器上确保)。如果我然后尝试卸载Vlibatlas3gf-baseV,则会再次自动安装apt-getliblapack3gf

我真的不知道如何处理这个问题,或者如何解决这个问题让Numpy 1.8与Travis合作。我还尝试了通过libblas3gf提供here来升级Numpy的建议,但在Travis中这没有用。

非常感谢任何帮助!

非常感谢!

解决方案:

我完成了对以下pip - 文件的回答,并得到herehere的进一步帮助:

.travis.yml

现在一切都按预期工作了。请注意:您将能够使用此设置导入和使用PyLab,请参阅以下注释以获得解释。

3 个答案:

答案 0 :(得分:3)

在持续集成工作流程中从源(无论是直接编译还是使用pip)构建科学python模块的速度很慢(numpy为15分钟,如果需要scipy则为15分钟),以及浪费资源。

您应该使用numpy的二进制分发,例如Anaconda提供的分发。对于Travis CI,您可以使用,

language: python

before_script:
  - wget http://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda-3.8.3-Linux-x86_64.sh -O miniconda.sh
  - chmod +x miniconda.sh
  - export PATH=/home/travis/miniconda/bin:$PATH
  - conda install --yes numpy=1.8

另请查看Travis CI的更完整setup example

答案 1 :(得分:2)

我尝试在Travis CI上安装带有pip的Numpy 1.8.2,它似乎有效。

以下是我的.travis.yml文件的内容:

language: python

before_script:
  - pip uninstall numpy -y
  - pip install -I numpy==1.8.2

script: python -c 'import numpy; print numpy.version.version'

您可以在此build log中看到它已成功打印1.8.2

希望这有帮助!

答案 2 :(得分:1)

Travis CI上的

numpy现在是pre-installed。对于预安装版本比最新numpy版本早的罕见情况,numpy binary releasesavailable from PyPI,因此无需构建{{1} Travis CI。

摘自example .travis.yml file

numpy