AWK：如果左列小于右列，则需要在两列之间交换值

Question

所以到目前为止我得到的是一个Bed-Table文件，这个文件的问题是，在某些行中，第2列中的值大于第3列中的值。

在awk中是否有任何一个衬垫，它会交换这两个值，这样表格总是得到col 2中较小的值而col 3中较大的值？

chr01    100    200
chr02    300    150 

所以在这个例子中，所需的输出是：

chr01    100    200
chr02    150    300 

Answer 1

如果列的顺序错误，只需使用临时变量交换列：

$ awk '$2 > $3 { temp = $3; $3 = $2; $2 = temp } 1' OFS='\t' file

最后的

1是{print}的常用简写，因此每行都会打印出来。将输出字段分隔符OFS设置为制表符保留格式。

可替换地：

$ awk -F'\t' '$2 > $3 { $0 = $1 FS $3 FS $2 } 1' file

如有必要，使用已设置为制表符的输入字段分隔符FS重新排列行的内容。

Answer 2

你可以使用awk，

awk '$2>$3{x=$3;$3=$2;$2=x}1' file

Answer 3

awk '{ printf("%s %d %d\n",$1,($2 < $3) ? $2 : $3,($2 < $3) ? $3 : $2) }' file