在python中导入igraph时,出现错误(见下文)。由于igraph不是蟒蛇的一部分,我执行了下面列出的安装步骤。
什么是libglpk.35.dylib,我该如何加载它,为什么会出现这个问题?
'' import igraph
'' Traceback (most recent call last):
'' File "<stdin>", line 1, in <module>
'' File "/Users/claushaslauer/anaconda/lib/python2.7/site-packages/igraph/__init__.py", line 34, in <module>
'' from igraph._igraph import *
'' ImportError: dlopen(/Users/claushaslauer/anaconda/lib/python2.7/site-packages/igraph/_igraph.so, 2): Library not loaded: /usr/local/lib/libgmp.10.dylib
'' Referenced from: /usr/local/lib/libglpk.35.dylib
'' Reason: image not found
ruby -e "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/master/install)"
brew install pkg-config
brew install igraph
brew install homebrew/science/igraph
pip install python-igraph
brew uninstall igraph
brew uninstall gmp
brew uninstall glkp
- Error: No such keg: /usr/local/Cellar/glkp
brew install igraph
==&GT;从homebrew / homebrew-science安装igraph ==&GT;安装igraph依赖:gmp ==&GT;正在下载https://homebrew.bintray.com/bottles/gmp-6.0.0a.yosemite.bottle。 已下载:/ Library/Caches/Homebrew/gmp-6.0.0a.yosemite.bottle.tar.gz ==&GT;浇注gmp-6.0.0a.yosemite.bottle.tar.gz 错误:brew链接步骤未成功完成 建立了公式,但没有符号链接到/ usr / local 无法使用符号链接包含/ gmp.h 目标/usr/local/include/gmp.h 已经存在。您可能想要删除它: rm&#39; /usr/local/include/gmp.h'
强制链接并覆盖所有冲突的文件: brew link --overwrite gmp
列出要删除的所有文件: brew链接--overwrite --dry-run gmp
可能存在冲突的文件: /usr/local/include/gmp.h /usr/local/lib/libgmp.a ==&GT;摘要 /usr/local/Cellar/gmp/6.0.0a:15个文件,3.2M ==&GT;安装igraph ==&GT;正在下载https://homebrew.bintray.com/bottles-science/igraph-0.7.1.yosemi 已下载:/ Library/Caches/Homebrew/igraph-0.7.1.yosemite.bottle.tar.gz ==&GT;浇注igraph-0.7.1.yosemite.bottle.tar.gz /usr/local/Cellar/igraph/0.7.1:83个文件,6.4M
brew link
步骤未成功完成&#34;暗示?/usr/local/lib/libglpk.35.dylib
相关的任何内容 - 当我现在调用python时,发生了与之前相同的错误。感谢Evert的额外答案。有了这个内容,我现在可以导入igraph。有三点需要注意:
当我说brew tap homebrew/sciene
时,使用我的github凭据登录,我得
remote: Repository not found.
fatal: repository 'https://github.com/Homebrew/homebrew-sciene/' not found
Error: Failure while executing: git clone https://github.com/Homebrew/homebrew-sciene /usr/local/Library/Taps/homebrew/homebrew-sciene --depth=1
我不确定这是多么重要,事实证明,如果没有这个,我可以运行igraph。但是,网址https://github.com/Homebrew/homebrew-sciene/
会为我生成404错误。
brew search glpk
和brew search igraph
都返回指向homebrew/science/...
的一行输出
brew link --overwrite gmp
说它创建了11个符号链接。我认为这就解决了我的问题所以现在我可以在python中导入igraph。
感谢您的帮助。
答案 0 :(得分:3)
缺少glpk
依赖项,因为在安装igraph
时,只搜索默认包。 glpk
就像igraph
一样,在一个名为homebrew/science的额外自制仓库中生活。您可以通过“点击”它自动访问该存储库:
brew tap homebrew/science
现在,还会搜索此存储库中包含的所有包。要确认,请尝试查看以下两个命令是否仅返回包名称:
brew search glpk
brew search igraph
在重新安装igraph
之前,您必须修复gmp
的链接问题;这只是自制程序在卸载步骤中没有完全卸载igraph
及其依赖项的结果。为此,您可以按照自制软件的建议:
brew link --overwrite gmp
(您正在使用之前仍然部分安装的gmp
软件包覆盖gmp
软件包;它们是相同的,因此不会造成任何损害。)
现在,您应该可以安装igraph:
brew install igraph
如果这也提供了有关链接的警告/错误,请使用与--overwrite
相同的gmp
选项。
如果brew install igraph
未安装glpk
(即您没有看到“==&gt;安装igraph依赖:glpk”等消息),您可以单独安装:< / p>
brew install glpk
给出或采取一个小细节,你现在应该有一个工作igraph安装(并且,因为你从来没有卸载python-igraph,这应该仍然有效。)