Question

我试图找出forceNetwork（）中节点和链接数据帧的确切要求，因为我的网络显示彩色可移动点，没有连接它们的任何边缘，我不知道为什么。据我所知，要求是：

节点数据框必须具有：

与链接源名称完全匹配的nodeID列（如果节点与链接的顺序不同）。如果它们的顺序相同，则可以根据我对文档的阅读删除此参数。

一个组变量，它指定节点的组。不同的组是不同的颜色来区分它们。

链接数据框必须具有：

源列（将与目标连接的节点列表）

目标列

一个值列，指定要在节点

之间绘制的线的权重

> head(links)
  source target value
1  11170      7     1
2   2840      2     1
3  32595      2     1
4  45410      8     1
5  52720     12     1
6  61720      6     1
> head(nodes)
  nodeID group
1  11170     2
2   2840     1
3  32595     2
4  45410     3
5  52720     1
6  61720     2
> head(E(g))
Edge sequence:

[1] 7     -- 11170
[2] 2     -- 2840 
[3] 2     -- 32595
[4] 8     -- 45410
[5] 12    -- 52720
[6] 6     -- 61720
> head(V(g))
Vertex sequence:
[1] "11170" "2840"  "32595" "45410" "52720" "61720"

> typeof(nodes$nodeID[1])
[1] "integer"
> typeof(links$source[1])
[1] "integer"

> dim(links)
[1] 121   3
> dim(nodes)
[1] 135   2

> forceNetwork(Links = links, Nodes = nodes,Source = "source", Target = "target", NodeID = "nodeID",Group = "group", opacity = 0.8, colourScale = "d3.scale.category10()")

Answer 1

source数据框中的target 和 Links向量必须为数字，其值指的是{{}中节点的索引它们表示的数据帧（零索引，与R不同，因为它由JavaScript代码使用）。

Nodes数据框的nodeID向量提供每个节点的名称（字符或数字），当您将鼠标悬停在生成的可视化中的节点上时，会显示该名称。

根据您的示例数据，我怀疑您在Nodes中拥有的数据是节点的ID，而links$source中的数据则是其他数据。虽然它们都是数字向量，但这些值并不代表它们在links$target数据框中引用的节点的索引。

如果您的Nodes和links$source向量中有节点名称/ ID而不是links$target数据框中节点的索引，则可以像这样修复它...

Nodes

forceNetwork不显示任何边缘

1 个答案: