我能否以某种方式使用原子矢量参考子分配?
当然没有将它包装在1列data.table中以使用:=
。
library(data.table)
N <- 5e7
x <- sample(letters, N, TRUE)
X <- data.table(x = x)
upd_i <- sample(N, 1L, FALSE)
system.time(x[upd_i] <- NA_character_)
# user system elapsed
# 0.11 0.06 0.17
system.time(X[upd_i, x := NA_character_])
# user system elapsed
# 0.00 0.00 0.03
如果R6可以提供帮助,我可以打开R6解决方案,因为它已经是我的一个解决方案了。
我已经检查过<-
对象中的R6
仍然会复制:gist。
答案 0 :(得分:9)
在最近的R版本(3.1-3.1.2 +左右)中,向量的赋值不会复制。你不会通过运行OP的代码来看到它,原因如下。因为您重用了x
并将其分配给其他某个对象,所以不会通知R在该点复制x
,并且必须假定它不会(在上面的特定情况下,我认为在data.table::data.table
中更改它并通知R已经制作了副本会很好,但这是一个单独的问题 - data.frame
遭受同样的问题),并因此复制{{ 1}}首次使用。如果你稍微改变命令的顺序,你会发现没有区别:
x
(旧答案,大部分都是好奇心)
您实际上可以使用N <- 5e7
x <- sample(letters, N, TRUE)
upd_i <- sample(N, 1L, FALSE)
# no copy here:
system.time(x[upd_i] <- NA_character_)
# user system elapsed
# 0 0 0
X <- data.table(x = x)
system.time(X[upd_i, x := NA_character_])
# user system elapsed
# 0 0 0
# but now R will copy:
system.time(x[upd_i] <- NA_character_)
# user system elapsed
# 0.28 0.08 0.36
data.table
运算符来修改您的向量(我认为您需要R版本3.1+来避免:=
中的副本):
list
答案 1 :(得分:5)
根据@Frank的建议,可以使用Rcpp
执行此操作。这是一个包含受Rcpp dispatch.h
启发的宏的版本,它处理所有原子向量类型:
mod_vector.cpp
#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;
template <int RTYPE>
Vector<RTYPE> mod_vector_impl(Vector<RTYPE> x, IntegerVector i, Vector<RTYPE> value) {
if (i.size() != value.size()) {
stop("i and value must have same length.");
}
for (int a = 0; a < i.size(); a++) {
x[i[a] - 1] = value[a];
}
return x;
}
#define __MV_HANDLE_CASE__(__RTYPE__) case __RTYPE__ : return mod_vector_impl(Vector<__RTYPE__>(x), i, Vector<__RTYPE__>(value));
// [[Rcpp::export]]
SEXP mod_vector(SEXP x, IntegerVector i, SEXP value) {
switch(TYPEOF(x)) {
__MV_HANDLE_CASE__(INTSXP)
__MV_HANDLE_CASE__(REALSXP)
__MV_HANDLE_CASE__(RAWSXP)
__MV_HANDLE_CASE__(LGLSXP)
__MV_HANDLE_CASE__(CPLXSXP)
__MV_HANDLE_CASE__(STRSXP)
__MV_HANDLE_CASE__(VECSXP)
__MV_HANDLE_CASE__(EXPRSXP)
}
stop("Not supported.");
return x;
}
示例:
x <- 1:20
address(x)
#[1] "0x564e7e8"
mod_vector(x, 4:5, 12:13)
# [1] 1 2 3 12 13 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20
address(x)
#[1] "0x564e7e8"
与base和data.table方法的比较。可以看出它的速度要快得多:
x <- 1:2e7
microbenchmark::microbenchmark(mod_vector(x, 4:5, 12:13), x[4:5] <- 12:13, modify.vector(x, 4:5, 12:13))
#Unit: microseconds
# expr min lq mean median uq
# mod_vector(x, 4:5, 12:13) 5.967 7.3480 15.05259 9.718 21.0135
# x[4:5] <- 12:13 2.953 5.3610 45722.61334 48122.996 52623.1505
# modify.vector(x, 4:5, 12:13) 954.577 988.7785 1177.17925 1021.380 1361.1210
# max neval
# 58.463 100
# 126978.146 100
# 1559.985 100