Question

我在CPP中使用ITK编写了一个类，它读取目录中的所有文件，然后对它们进行平均。我想在使用Python构建的管道中使用此类。

我之前曾尝试使用Swig来包装模板代码但是根据swig documenation，它没有模板支持，并且需要明确指定类型名称。但是当我使用ITK in Python时，界面与我对Swig生成的模板代码的期望非常不同（类型名称根本没有在函数/类名中指定，这与Swig文档所说的相反）

我的代码中的一个小片段说明了该类的用法如下所示：

typedef unsigned char PixelType;
typedef itk::Image<PixelType, 2> ImageType;
typedef itk::NaryMeanImageFilter< ImageType, ImageType > FilterType; // custom class
typedef itk::ImageFileReader<ImageType> ReaderType;
typedef itk::ImageFileWriter<ImageType> WriterType;

ImageType::Pointer image = ImageType::New();
ReaderType::Pointer reader = ReaderType::New();
WriterType::Pointer writer = WriterType::New();
FilterType::Pointer filter = FilterType::New(); // custom class

for (unsigned int i = 0; i< fileNames.size(); ++i)
{
  reader->SetFileName(fileNames[i]);
  filter->SetInput(i, reader->GetOutput()); // custom class
}

writer->SetFileName(outName);
writer->SetInput(filter->GetOutput());
writer->Update();

可以在Git repository中看到该类的代码。我没有使用Boost :: Python增加项目依赖性的问题，但我需要一个起点继续。任何帮助都将非常感激。

感谢。

更新：

Python中的预期用法是，

readerType=itk.ImageFileReader[inputImageType]
reader=readerType.New()
filterType=itk.NaryMeanImageFilter[inputImageType,inputImageType]
filter=filterType.New()

for i in range(0, fileNames.size()):
    reader.SetFileName(fileNames[i])
    filter.SetInput(i, reader->GetOutput())

Answer 1

主要思想是使用WrapITK模块。它基本上使用内部ITK包装和解析机制（使用GCCXML for C ++进行XML解析 - 将来移动到CastXML）来生成SWIG用来生成Python包装代码的* .i文件。

基本理念：

假设您有一个想要在Python脚本中使用的ITK过滤器'itkDummy.h'
写一个文件'itkDummy.wrap'，提供有关像素类型和模板初始化的信息。
使用WrapITK模块（与ITK Python绑定一起） - 需要进行验证，因为每次尝试此操作时，我都会收到错误
很高兴itkDummy可以从Python调用

参考：http://www.itk.org/Wiki/ITK/Release_4/Wrapping/BuildProcess

这就是我要找的东西。

Answer 2

在Itk软件指南第一卷中。 1（http://itk.org/ITKSoftwareGuide/html/Book1/ITKSoftwareGuide-Book1ch3.html#x34-410003.7）他们解释说他们正在使用自己的包装：

gccxml，从C ++程序生成xml文件
一个名为igenerator.py的脚本，它为swig生成.i文件
痛饮

我之前从未这样做过，但您可以尝试通过他们的包装管道查看生成的* .i文件的样子（或者甚至可能包括您的本地ITK存储库中的过滤器，并查看是否自动包装作品）

如何在Python

2 个答案: