R函数用于创建和保存图形

时间:2015-05-13 21:22:28

标签: r graph

我正在尝试创建并保存多个图形。我是堆栈的情况下,factoextra包用于制作图表。

  pca.plot<-function(x){
  biplot<-paste(out_f,"\\biplot.jpg", sep="")
  jpeg(file=biplot, type="cairo")
  fviz_pca_biplot(x,  geom = "text")
  dev.off()
}

这是一个简单的函数,从输入pca对象创建一个双标图(使用FactoMineR包创建的pca) out_f先前已定义。 当我逐行运行脚本时,它可以工作。当我将其作为脚本运行时,会创建一个坚果。

  pca.plot<-function(x){
  pve<-paste(out_f,"\\proportion_of_variance_explained.jpg", sep="")
  jpeg(file=pve, type="cairo")
  barplot(x$eig[,2], names.arg=1:nrow(x$eig),
          main = "Variances",
          xlab = "Principal Components",
          ylab = "Percentage of variances",
          col ="steelblue")
  lines(x = 1:nrow(x$eig), x$eig[, 2], type="b", pch=19, col = "red")
  dev.off()   
}

在这种情况下没有问题。有谁知道为什么第一种情况会出现问题?

提前致谢, 约翰

1 个答案:

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factoextra生成的图是ggplot2。您应该使用print(fviz_pca_biplot(res.pca)),如下所示:

# Principal component analysis
data(iris)
res.pca <- prcomp(iris[, -5],  scale = TRUE)

# This will do nothing
jpeg("biplot.jpg")
fviz_pca_biplot(res.pca)
dev.off()

# This will do the right thing
jpeg("biplot.jpg")
print(fviz_pca_biplot(res.pca))
dev.off()

祝你好运!