使用awk比较两个文件时文件名上的语法错误

Question

如果第1列或第5列中的数字在file1中，我正在尝试使用awk打印一个文件2中包含的行，但是我收到了一个我不理解的语法错误。

我的意见是：

file1.dat

1
3
4
6
8
13
14
25

etc...

File2.DAT的

2 GLU 1 - 3 ARG 2
24 ASP 2 - 12 LYS 1
3 ASP 1 - 25 ARG 2
7 LYS 2 - 17 GLU 2
18 ARG 1 - 13 GLU 2

etc...

在这种情况下，我想要输出

2 GLU 1 - 3 ARG 2
3 ASP 1 - 25 ARG 2
18 ARG 1 - 13 GLU 2

我尝试使用以下awk-line

执行此操作

awk -F 'NR==FNR{a[$1||$5]++;next} (a[$1||$5])' file1.dat file2.dat

但我收到了错误

awk: file1.dat
awk:      ^syntax error

有谁知道导致此错误的原因是什么？我试图将文件名放入变量但产生相同的错误。

Answer 1

您已为字段分隔符提供了-F标记。因此，下一个参数是字段分隔符（这是您的脚本，因为您没有提供分隔符）。所以awk将第一个文件作为脚本本身。

尝试放弃-F或添加分隔符，例如awk -F '[ \t]*' '...' file1 file2。