Question

在花了很长时间研究如何安装SparkR后，我认为该软件包可能存在一些问题......

请记住，我是新手，所以我不确定我是否做了正确的事。

从一个新的EC2 ubuntu 64位实例我安装了R和JDK

我git克隆了apache spark repo并用它构建了它：

git clone https://github.com/apache/spark.git
cd spark
build/mvn -DskipTests -Psparkr package

然后我通过包含以下行来改变我的.Rprofile以引用R目录....

Sys.setenv(SPARK_HOME="/home/ubuntu/spark")
.libPaths(c(file.path(Sys.getenv("SPARK_HOME"), "R", "lib"), .libPaths()))

然后在启动R后，尝试运行给定here

的快速入门指南

以下是我采取的以下步骤......

 R> library(SparkR)
 R> sc <- sparkR.init(master="local")
 R> textFile <- SparkR:::textFile(sc, "/home/ubuntu/spark/README.md")
 R> cc <- SparkR:::count(textFile)
 R> t10 <- SparkR:::take(textFile,10)

所有工作都很好，直到这里...下面的行不起作用......

 R> SparkR:::filterRDD(textFile, function(line){ grepl("Spark", line)})
 Error: class(objId) == "jobj" is not TRUE

 R> traceback()
 7: stop(sprintf(ngettext(length(r), "%s is not TRUE", "%s are not all TRUE"), 
   ch), call. = FALSE, domain = NA)
 6: stopifnot(class(objId) == "jobj")
 5: callJMethod(object@jrdd, "toString")
 4: paste(callJMethod(object@jrdd, "toString"), "\n", sep = "")
 3: cat(paste(callJMethod(object@jrdd, "toString"), "\n", sep = ""))
 2: function (object) 
    standardGeneric("show")(x)
 1: function (object) 
    standardGeneric("show")(x)

另一个不起作用的例子如下。

 R> SparkR:::flatMap(textFile,
         function(line) {
            strsplit(line, " ")[[1]]
               })
  Error: class(objId) == "jobj" is not TRUE

以下是我的会话信息......

 R> > sessionInfo()
 R version 3.2.0 (2015-04-16)
 Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
 Running under: Ubuntu 14.04.2 LTS

 locale:
  [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
  [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
  [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
  [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                 
  [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
 [11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

 attached base packages:
 [1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

 other attached packages:
 [1] SparkR_1.4.0

非常感谢任何帮助......

Answer 1

所以这实际上是SparkR中RDD的show方法中的一个错误，我在https://issues.apache.org/jira/browse/SPARK-7512

记录了这个

但是这个bug不应该以任何方式影响你的计算。所以，如果你改为使用

filteredRDD <- SparkR:::filterRDD(textFile, function(line){ grepl("Spark", line)})

然后错误消息应该消失

SparkR filterRDD和flatMap无法正常工作

1 个答案: