Question

我在php中从命令行运行程序时遇到一些问题。每当我在命令行中运行程序时，都会创建正确的文件并且它可以正常工作。然而，当我把它放在我的php并使用exec（）函数时，没有任何反应。

最后，我希望用户能够选择他想要在外部程序上运行的参数，但是现在我只想尝试使用硬编码值运行....

这是我用来从命令行运行程序及其参数的命令。

 [path1] -p blastp -d [parameter1] -i [path2] -e [parameter2] -m 9 -o [path3]

 where [path1] is the path to ../blast-2.2.26/bin/blastall, 
       [path2] is the path to sample.fasta
       [path3] is the path for the output file (you may want to create another folder for generating the output)
       [parameter1] is the name of database chosen by the user from your page (eg. Human.db, Viruses.db, etc)
       [parameter2] is the E-value given by the user from your page(eg. 0.0001, 1, 1000, etc)

我在命令行中输入的实际代码是

~/blast/blast-2.2.26/bin/blastall -p blastp -d db -i ~/temp/sample.fasta -m 9 -o output'

到目前为止，这是我的代码。

<form method="POST", action="/~cs4380sp15grp4/home/blast.php">


<?php
    session_start();
    require_once '../secure/database.php';
    $mysqli = new mysqli($dbhost,$dbuser,$dbpass,$dbname);

    if($mysqli->connect_error){
            exit('CON Error: ' . $mysqli->connect_errno . ' ' . $mysqli->connect_error);
    }

    //Insert the values into the database

    if(isset($_POST['submit'])){


            $db = $_POST['database'];
            $evalue = $_POST['evalue'];
            $sequence = $_POST['BlastSearch'];



             exec('/students/groups/cs4380sp15grp4/blast/blast-2.2.26/bin/blastall -p blastp -d db -i /students/groups/cs4380sp15grp4/temp/sample.fasta -m 9 -o /students/groups/cs4380sp15grp4/temp/output');
    }





?>

所以我的exec函数不能在我的php页面中工作，因为同样的命令在终端中有效。

Answer 1

Apache服务器用户是否可以访问此程序？要确保，请尝试运行sudo chmod 755 /students/groups/cs4380sp15grp4/blast/blast-2.2.26/bin/blastall并重试。

同样，确保Apache进程可以访问输入和输出目录。

php中的exec（）函数出错

1 个答案: