Question

您好我需要在文件夹中更改这些文件名：

dingo__AAA311P02_2845__L7_ACTTGA_L007_R1_001.fastq.gz
lala_bros__AAA000M11_3289__L2_ACTGAT_L002_R2_001.fastq.gz
nice__AAA827M10_2860__L7_ACTGAT_L007_R2_001.fastq.gz

我需要保留AAA ******（例如AAA255P02）并保留R1或R2和扩展名fastq.gz

理想情况下，我想得到这些：
AAA311P02_R1.fastq.gz AAA000M11_R2.fastq.gz AAA827M10_R2.fastq.gz

我尝试过使用 rename 's/^.*$AAA[1-9][1-9][1-9][A-Z][1-9][1-9]$.*$/\$1/g' *.fastq.gz

Answer 1

$...$搜索括号，但不捕获其内容。

我看到有三个块被捕获，所以我建议如下：

rename 's/^.*(AAA.{6}).*(_R.).*(\.fastq.gz)/$1$2$3/' *.fastq.gz

第一个阻止：AAA后跟六个字符。

第二个区块：_R后跟一个字符。

第3块：扩展名.fastq.gz

在linux中使用regex重命名文件

1 个答案: