坚持和&&命令

时间:2015-04-27 11:07:08

标签: bash

我正在尝试在终端中同时运行两个命令,但似乎第二个命令不是与第一个命令同时启动。

我想看到'python'线和'samtools'并行运行。

python -m HTSeq.scripts.count -m intersection-nonempty -f sam -a 20 -t mRNA -i Parent -s yes plate.sam $GFF | awk 'n>=5 { print a[n%5] } { a[n++%5]=$0 }' > plate_F.counts &&

samtools view -h -o exvivo.sam V_S1_L001_aln-pe.bam

2 个答案:

答案 0 :(得分:3)

&&and中的逻辑Bash运算符,在command_a && command_b这样的构造中大量使用,它只是“运行第一个命令的快捷方式,并且在成功时返回代码运行第二个命令“。

在您的情况下,很可能第一个命令python -m ...以非零代码退出,这会阻止第二个命令运行。

如果您需要第二个命令无条件地运行,但无论出于何种原因希望它们在同一行上,您可以使用command_a; command_b。或者更严格的是,command_a || true; command_b

答案 1 :(得分:1)

&&仅在命令完成之前返回0时执行命令。previous answer可能会更清晰