我有一个.fa文件，其中包含一些核苷酸的secuences列表。它是这样的
AGCTAGAGAGACTAGACTAGA
GATCAGTACATGATCTAGGAT
GATAGTACATGGGGGATAGAC
我需要以某种方式在python中打开文件并创建一个2-dim数组，其中包含.fa文件的行和每列中的文件的字母。谢谢你的帮助!!!!
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如果您对将矩阵作为列表列表感兴趣，可以使用列表理解轻松完成。
1 762097 6706109 6 gain
1 7202143 7792617 3 gain
1 8922949 9815420 1 loss
1 10502346 11074110 3 gain
1 11188922 12267136 1 loss
1 12566829 13910626 4 gain
另一方面，如果您希望使用with open("myfile.fa","rt") as infile:
matrix = [list(line.strip()) for line in infile.readlines()]
print matrix
矩阵（请注意，这需要您安装numpy）：
numpy