如何在Haskell中提高这种数值计算的性能?

时间:2010-06-05 03:14:43

标签: c performance math haskell

我正在将David Blei的潜在Dirichlet分配的原始C implementation移植到Haskell,我正在尝试决定是否在C中留下一些低级别的东西。以下函数是一个例子 - 它是lgamma的二阶导数的近似值:

double trigamma(double x)
{
    double p;
    int i;

    x=x+6;
    p=1/(x*x);
    p=(((((0.075757575757576*p-0.033333333333333)*p+0.0238095238095238)
         *p-0.033333333333333)*p+0.166666666666667)*p+1)/x+0.5*p;
    for (i=0; i<6 ;i++)
    {
        x=x-1;
        p=1/(x*x)+p;
    }
    return(p);
}

我已将其转化为或多或少惯用的Haskell,如下所示:

trigamma :: Double -> Double
trigamma x = snd $ last $ take 7 $ iterate next (x' - 1, p')
  where
    x' = x + 6
    p  = 1 / x' ^ 2
    p' = p / 2 + c / x'
    c  = foldr1 (\a b -> (a + b * p)) [1, 1/6, -1/30, 1/42, -1/30, 5/66]
    next (x, p) = (x - 1, 1 / x ^ 2 + p)

问题在于,当我通过Criterion运行时,我的Haskell版本慢了六到七倍(我在GHC 6.12.1上用-O2进行编译)。一些类似的功能甚至更糟。

我对Haskell的性能几乎一无所知,而且我对digging through Core或类似的东西并不十分感兴趣,因为我总是可以通过FFI调用少数数学密集型C函数。

但是我很好奇我是否还缺少一些低调的水果 - 某种扩展,图书馆或注释,我可以用来加速这些数字而不会让它太难看。


更新:由于Don StewartYitz,以下是两个更好的解决方案。我稍微修改了Yitz的答案以使用Data.Vector

invSq x = 1 / (x * x)
computeP x = (((((5/66*p-1/30)*p+1/42)*p-1/30)*p+1/6)*p+1)/x+0.5*p
  where p = invSq x

trigamma_d :: Double -> Double
trigamma_d x = go 0 (x + 5) $ computeP $ x + 6
  where
    go :: Int -> Double -> Double -> Double
    go !i !x !p
        | i >= 6    = p
        | otherwise = go (i+1) (x-1) (1 / (x*x) + p)

trigamma_y :: Double -> Double
trigamma_y x = V.foldl' (+) (computeP $ x + 6) $ V.map invSq $ V.enumFromN x 6

两者的性能似乎几乎完全相同,其中一个或另一个赢得一个或两个百分点,具体取决于编译器标志。

正如camccann所说over at Reddit,故事的寓意是“为了获得最佳效果,请使用Don Stewart作为GHC后端代码生成器。”除了这个解决方案之外,最安全的选择似乎只是将C控制结构直接转换为Haskell,尽管循环融合可以以更惯用的方式提供类似的性能。

我可能最终会在我的代码中使用Data.Vector方法。

2 个答案:

答案 0 :(得分:49)

使用相同的控制和数据结构,产生:

{-# LANGUAGE BangPatterns #-}
{-# OPTIONS_GHC -fvia-C -optc-O3 -fexcess-precision -optc-march=native #-}

{-# INLINE trigamma #-}
trigamma :: Double -> Double
trigamma x = go 0 (x' - 1) p'
    where
        x' = x + 6
        p  = 1 / (x' * x')

        p' =(((((0.075757575757576*p-0.033333333333333)*p+0.0238095238095238)
                  *p-0.033333333333333)*p+0.166666666666667)*p+1)/x'+0.5*p

        go :: Int -> Double -> Double -> Double
        go !i !x !p
            | i >= 6    = p
            | otherwise = go (i+1) (x-1) (1 / (x*x) + p)

我没有你的测试套件,但这会产生以下asm:

A_zdwgo_info:
        cmpq    $5, %r14
        jg      .L3
        movsd   .LC0(%rip), %xmm7
        movapd  %xmm5, %xmm8
        movapd  %xmm7, %xmm9
        mulsd   %xmm5, %xmm8
        leaq    1(%r14), %r14
        divsd   %xmm8, %xmm9
        subsd   %xmm7, %xmm5
        addsd   %xmm9, %xmm6
        jmp     A_zdwgo_info

哪个看起来不错。这是-fllvm后端做得很好的代码。

GCC展开循环,唯一的方法是通过Template Haskell或手动展开。如果做了很多这样的话,你可能会考虑(一个TH宏)。

实际上,GHC LLVM后端会展开循环: - )

最后,如果您真的喜欢原始的Haskell版本,请使用stream fusion combinators,编写它,GHC会将其转换回循环。 (为读者练习)。

答案 1 :(得分:8)

在优化工作之前,我不会说你的原始翻译是在Haskell中表达C代码的最惯用的方式。

如果我们开始使用以下内容,优化过程将如何进行:

trigamma :: Double -> Double
trigamma x = foldl' (+) p' . map invSq . take 6 . iterate (+ 1) $ x
where
  invSq y = 1 / (y * y)
  x' = x + 6
  p  = invSq x'
  p' =(((((0.075757575757576*p-0.033333333333333)*p+0.0238095238095238)
              *p-0.033333333333333)*p+0.166666666666667)*p+1)/x'+0.5*p