我开始使用KnitR进行动态报告。我写了一个块来获取特定目录中的文件数量......
```{r, echo=FALSE}
correct_gtfiles <- list.files("data/")
nr_corrGT <- length(correct_gtfiles)
```
...我想在以下文字部分中使用它:
We have `r nr_corrGT` files.
然而,当我编织PDF时,它输出“... 0文件”而不是“114文件”。 当我在RStudio控制台中复制块的两行时,我得到正确的数字:
> nr_corrGT
[1] 114
我做错了什么?
答案 0 :(得分:1)
因为knitr和console的工作目录不一样。请尝试以下:
```{r, echo=FALSE}
correct_gtfiles <- list.files("data/")
nr_corrGT <- length(correct_gtfiles)
```
We have `r nr_corrGT` files.
Current working directory is: `r getwd()`
我们需要设置工作目录 - setwd()
或提供list.files
的完整路径。