我有大型C项目，我手动编译，然后通过GDB进行调试。
我已经在Eclipse中编辑源代码了，但由于复杂的多个makefile，我无法在那里编译它。
是否只能通过Eclipse启动应用程序以通过GDB进行调试？
由于
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是的，您可以设置调试器以指向二进制文件并启动它。只需确保使用正确的标志（-ggdb和-g3表示符号）进行编译。如果将它作为Makefile项目导入，它应该能够自动将代码映射到符号。
基本说明如下：http://eclipse.org/jetty/documentation/current/debugging-with-eclipse.html