如何检查Pandas DataFrame中的任何值是否为NaN

时间:2015-04-09 05:09:40

标签: python pandas dataframe nan

在Python Pandas中,检查DataFrame是否有一个(或多个)NaN值的最佳方法是什么?

我知道函数pd.isnan,但这会为每个元素返回一个布尔数据框架。 This post就在这里也没有完全回答我的问题。

22 个答案:

答案 0 :(得分:443)

jwilner的反应很明显。我正在探索是否有更快的选择,因为根据我的经验,求平面阵列(奇怪地)比计数更快。这段代码似乎更快:

df.isnull().values.any()

例如:

In [2]: df = pd.DataFrame(np.random.randn(1000,1000))

In [3]: df[df > 0.9] = pd.np.nan

In [4]: %timeit df.isnull().any().any()
100 loops, best of 3: 14.7 ms per loop

In [5]: %timeit df.isnull().values.sum()
100 loops, best of 3: 2.15 ms per loop

In [6]: %timeit df.isnull().sum().sum()
100 loops, best of 3: 18 ms per loop

In [7]: %timeit df.isnull().values.any()
1000 loops, best of 3: 948 µs per loop

df.isnull().sum().sum()有点慢,但当然还有其他信息 - NaNs的数量。

答案 1 :(得分:135)

你有几个选择。

import pandas as pd
import numpy as np

df = pd.DataFrame(np.random.randn(10,6))
# Make a few areas have NaN values
df.iloc[1:3,1] = np.nan
df.iloc[5,3] = np.nan
df.iloc[7:9,5] = np.nan

现在数据框看起来像这样:

          0         1         2         3         4         5
0  0.520113  0.884000  1.260966 -0.236597  0.312972 -0.196281
1 -0.837552       NaN  0.143017  0.862355  0.346550  0.842952
2 -0.452595       NaN -0.420790  0.456215  1.203459  0.527425
3  0.317503 -0.917042  1.780938 -1.584102  0.432745  0.389797
4 -0.722852  1.704820 -0.113821 -1.466458  0.083002  0.011722
5 -0.622851 -0.251935 -1.498837       NaN  1.098323  0.273814
6  0.329585  0.075312 -0.690209 -3.807924  0.489317 -0.841368
7 -1.123433 -1.187496  1.868894 -2.046456 -0.949718       NaN
8  1.133880 -0.110447  0.050385 -1.158387  0.188222       NaN
9 -0.513741  1.196259  0.704537  0.982395 -0.585040 -1.693810
  • 选项1 df.isnull().any().any() - 返回布尔值

您知道isnull()将返回如下数据框:

       0      1      2      3      4      5
0  False  False  False  False  False  False
1  False   True  False  False  False  False
2  False   True  False  False  False  False
3  False  False  False  False  False  False
4  False  False  False  False  False  False
5  False  False  False   True  False  False
6  False  False  False  False  False  False
7  False  False  False  False  False   True
8  False  False  False  False  False   True
9  False  False  False  False  False  False

如果您使用df.isnull().any(),则只能找到包含NaN值的列:

0    False
1     True
2    False
3     True
4    False
5     True
dtype: bool

另外一个.any()会告诉您上述任何一项是True

> df.isnull().any().any()
True
  • 选项2 df.isnull().sum().sum() - 返回NaN值总数的整数:

这与.any().any()的操作方式相同,首先给出一列中NaN值的总和,然后是这些值的总和:

df.isnull().sum()
0    0
1    2
2    0
3    1
4    0
5    2
dtype: int64

最后,获取DataFrame中NaN值的总数:

df.isnull().sum().sum()
5

答案 2 :(得分:42)

要找出特定列中哪些行具有NaN:

SELECT name,
       SUM(CASE WHEN YEAR(TransDate) = 2014
                THEN COALESCE(credit, 0) - COALESCE(debit, 0)
                ELSE 0
           END) as credit_debit_2014,
       SUM(CASE WHEN YEAR(TransDate) = 2015
                THEN COALESCE(credit, 0) - COALESCE(debit, 0)
                ELSE 0
           END) as credit_debit_2015,
       SUM(CASE WHEN YEAR(TransDate) = 2016
                THEN COALESCE(credit, 0) - COALESCE(debit, 0)
                ELSE 0
           END) as credit_debit_2016
FROM table1
GROUP BY name;

答案 3 :(得分:36)

如果你需要知道有多少行"一个或多个NaN s":

df.isnull().T.any().T.sum()

或者如果你需要拉出这些行并检查它们:

nan_rows = df[df.isnull().T.any().T]

答案 4 :(得分:30)

df.isnull().any().any()应该这样做。

答案 5 :(得分:15)

添加到Hobs的精彩回答,我对Python和Pandas都很陌生,所以请指出我是不是错了。

找出哪些行有NaN:

nan_rows = df[df.isnull().any(1)]

将执行相同的操作而不需要通过将any()的轴指定为1进行转置来检查是否真的'存在于行中。

答案 6 :(得分:10)

由于没有人提到,只有另一个名为hasnans的变量。

如果pandas系列中的一个或多个值为NaN,则

df[i].hasnans将输出到True,如果不是,则Falserecv请注意,它不是一个功能。

pandas version'0.19.2'和'0.20.2'

答案 7 :(得分:7)

由于pandas必须为DataFrame.dropna()找到这个,我看了看他们是如何实现它的,并发现他们使用了DataFrame.count(),它计算所有非空DataFrame中的值。参看pandas source code。我没有对这种技术进行基准测试,但我认为图书馆的作者可能已经做出明智的选择。

答案 8 :(得分:5)

刚刚使用 math.isnan(x),如果x是NaN(不是数字),则返回True,否则返回False。

答案 9 :(得分:3)

超级简单语法:df.isna().any(axis=None)

Starting from v0.23.2,您可以使用DataFrame.isna + DataFrame.any(axis=None),其中axis=None指定整个DataFrame的逻辑归约。

# Setup
df = pd.DataFrame({'A': [1, 2, np.nan], 'B' : [np.nan, 4, 5]})
df
     A    B
0  1.0  NaN
1  2.0  4.0
2  NaN  5.0

df.isna()

       A      B
0  False   True
1  False  False
2   True  False

df.isna().any(axis=None)
# True

有用的选择

numpy.isnan
如果您运行的是旧版熊猫,则是另一个性能选择。

np.isnan(df.values)

array([[False,  True],
       [False, False],
       [ True, False]])

np.isnan(df.values).any()
# True

或者,检查总和:

np.isnan(df.values).sum()
# 2

np.isnan(df.values).sum() > 0
# True

Series.hasnans
您还可以迭代地调用Series.hasnans。例如,要检查单个列是否具有NaN,

df['A'].hasnans
# True

要检查 any 列是否具有NaN,可以对any使用理解(这是一种短路操作)。

any(df[c].hasnans for c in df)
# True

这实际上非常很快。

答案 10 :(得分:2)

这是找到空值并替换为计算值的另一种有趣方式

    #Creating the DataFrame

    testdf = pd.DataFrame({'Tenure':[1,2,3,4,5],'Monthly':[10,20,30,40,50],'Yearly':[10,40,np.nan,np.nan,250]})
    >>> testdf2
       Monthly  Tenure  Yearly
    0       10       1    10.0
    1       20       2    40.0
    2       30       3     NaN
    3       40       4     NaN
    4       50       5   250.0

    #Identifying the rows with empty columns
    nan_rows = testdf2[testdf2['Yearly'].isnull()]
    >>> nan_rows
       Monthly  Tenure  Yearly
    2       30       3     NaN
    3       40       4     NaN

    #Getting the rows# into a list
    >>> index = list(nan_rows.index)
    >>> index
    [2, 3]

    # Replacing null values with calculated value
    >>> for i in index:
        testdf2['Yearly'][i] = testdf2['Monthly'][i] * testdf2['Tenure'][i]
    >>> testdf2
       Monthly  Tenure  Yearly
    0       10       1    10.0
    1       20       2    40.0
    2       30       3    90.0
    3       40       4   160.0
    4       50       5   250.0

答案 11 :(得分:2)

通过使用seaborn模块heatmap生成热图,我们可以看到数据集中存在的空值

import pandas as pd
import seaborn as sns
dataset=pd.read_csv('train.csv')
sns.heatmap(dataset.isnull(),cbar=False)

答案 12 :(得分:2)

我一直在使用以下内容,并将其强制转换为字符串并检查nan值

   (str(df.at[index, 'column']) == 'nan')

这使我可以检查序列中的特定值,而不仅仅是返回该值是否包含在序列中。

答案 13 :(得分:1)

df.apply(axis=0, func=lambda x : any(pd.isnull(x)))

将检查每一列是否包含Nan。

答案 14 :(得分:1)

或者您可以在.info()上使用DF,例如:

df.info(null_counts=True)会返回列中的非空行数,例如:

<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
Int64Index: 3276314 entries, 0 to 3276313
Data columns (total 10 columns):
n_matches                          3276314 non-null int64
avg_pic_distance                   3276314 non-null float64

答案 15 :(得分:1)

最好是使用:

df.isna().any().any()

这里是why。因此,isna()用于定义isnull(),但这两个当然是相同的。

这比接受的答案还要快,并且涵盖了所有2D熊猫阵列。

答案 16 :(得分:1)

import missingno as msno
msno.matrix(df)  # just to visualize. no missing value.

enter image description here

答案 17 :(得分:0)

df.isnull()。sum()   这将为您提供DataFrame中所有NaN值的计数

答案 18 :(得分:0)

df为Pandas DataFrame的名称,而numpy.nan的任何值均为空值。

  1. 如果您想查看哪些列包含空值,哪些不包含空值(仅True和False)
    df.isnull().any()
  2. 如果您只想查看包含空值的列
    df.loc[:, df.isnull().any()].columns
  3. 如果要查看列中的空值计数
    df.loc[:, list(df.loc[:, df.isnull().any()].columns)].isnull().sum()
  4. 如果要查看列中空值的百分比
    df.loc[:, list(df.loc[:, df.isnull().any()].columns)].isnull().sum()/(len(air_price))*100

编辑1: 如果要直观地查看数据丢失的地方:
import missingno
missingdata_df = df.columns[df.isnull().any()].tolist()
missingno.matrix(df[missingdata_df])

答案 19 :(得分:0)

为此,我们可以使用语句 df.isna().any() 。这将检查我们所有的列并返回 True 如果有任何缺失值或 NaNFalse 如果没有缺失值。

答案 20 :(得分:-1)

您不仅可以检查是否存在“ NaN”,还可以使用以下命令获取每一列中“ NaN”的百分比,

dplyr

答案 21 :(得分:-1)

根据您要处理的数据类型,您还可以通过将dropna设置为False来获取执行EDA时每列的值计数。

for col in df:
   print df[col].value_counts(dropna=False)

适用于分类变量,而不是在有许多唯一值时。