我正在尝试创建一个PNG文件。
下面的脚本执行时没有返回任何错误,无法查看输出文件tester.png
(并且cmd窗口打印附加的附加文本)。
我不知道为什么我无法查看此脚本生成的PNG文件。
我同时使用了Active Perl(5.18.2)和Strawberry Perl(5.18.4.1),但同样存在问题。虽然我没有收到任何错误,但我尝试了草莓Perl,因为它有libgd
和libpng
作为安装的一部分。有什么建议吗?
#!/usr/bin/perl
use Bio::Graphics;
use Bio::SeqFeature::Generic;
use strict;
use warnings;
my $infile = "data1.txt";
open( ALIGN, "$infile" ) or die;
my $outputfile = "tester.png";
open( OUTFILE, ">$outputfile" ) or die;
my $panel = Bio::Graphics::Panel->new(
-length => 1000,
-width => 800
);
my $track = $panel->add_track(
-glyph => 'generic',
-label => 1
);
while (<ALIGN>) { # read blast file
chomp;
#next if /^\#/; # ignore comments
my ( $name, $score, $start, $end ) = split /\t+/;
my $feature = Bio::SeqFeature::Generic->new(
-display_name => $name,
-score => $score,
-start => $start,
-end => $end
);
$track->add_feature($feature);
}
binmode STDOUT;
print $panel->png;
print OUTFILE $panel->png;
答案 0 :(得分:2)
你有
binmode STDOUT;
print $panel->png;
有趣的是,你也有:
print OUTFILE $panel->png;
但你永远不会binmode OUTFILE
。因此,您在命令提示符下显示PNG文件的内容,并创建一个损坏的PNG文件。 (另见When bits don't stick。)
如果删除print OUTFILE ...
,并将脚本输出重定向到PNG文件,则应该能够在图像查看器中查看其内容。
C:\> perl myscript.pl > panel.png
或者,您可以避免将二进制文件的内容打印到控制台窗口,而是使用
binmode OUTFILE;
print $panel->png;