RadViz＆amp; R中的调查/置换矩阵图

Question

我目前正在为多元数据分析的研究生课程做一个简短的演讲。它是关于显示多变量数据（用于人类理解）的方法，以及我们应该呈现的六种方法，我已经采用了radial visualization plots（特别是所指的类型）作为＆＃34; RadViz＆＃34;）和调查图（这是各种排列矩阵可视化，或者我已经从我的研究中了解）。虽然我已经能够找到足够的资源来使用这些可视化方法，以及它们的优点/缺点，但我在查找代码以在R中实现它们时遇到了问题。

我找到了两个用户编写的函数，这些函数将在R中执行survey plots和radial visualization。这些函数似乎是＆＃34; dprep＆＃34;的一部分，从那时起就停止了CRAN - 并尽可能地尝试，当我从存档中下载旧版本时，我似乎无法将其作为包安装。此外，所有这些代码现在已经有六年了，而且还有几个版本的数据，如果它在某些时候可能完全无法使用，我会犹豫是否推荐给同学。

我想我要问的是，是否有更简单或更清洁的方式 - 可能作为现有包的一部分 - 在R中实现这些可视化，或者如果我唯一的选择是使用上述（非常做旧的代码。我知道其他编程语言（Python）以及其他软件（Orange，VisuLab）的解决方案，但由于该课程主要基于使用R，我希望能够呈现如果我可以的话。

Answer 1

听起来我们需要教你搜索。谷歌途径始终可用，但对于R功能，如果主题名称通常用于其他概念，它有时不够具体。我经常将搜索词与'rproject'配对

https://www.google.com/search?q=radviz&ie=utf-8&oe=utf-8#q=radviz+rproject

带来：

http://www.cs.uml.edu/~phoffman/Radviz/readme.txt # R interface to C-implementation

......以及许多其他人，但需要花费一些精力才能找到特定于R的实现。

我在sos包中使用findFn - 函数取得了很多成功：

install.packages("sos")
library(sos)

最初我认为这只是普通的雷达图，但似乎可能是不同的东西。

> findFn("Radial Coordinate Visualization")
found 12 matches;  retrieving 1 page

Downloaded 4 links in 3 packages. 

对Radviz的搜索仅显示单个项目radviz2d，其帮助页面链接到同一个包'dprep'中的surveyplot函数。单独的“径向”一词带来了很多，可能无法管理：

> findFn("radial plots")
found 456 matches;  retrieving 20 pages, 400 matches.
2 3 4 5 6 7 8 9 10 
11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 

这些条款提供了更易于管理的数字。雷达图或蜘蛛图通常用于离散变量，但径向坐标可视化似乎是在二维域上投影多变量关联的方法。 “循环”包还处理连续变量的显示和统计。

从CRAN档案中我下载并解压缩了版本2.1的radviz：dprep_2.1.tar.gz：

source('~/Downloads/dprep/R/radviz2d.R', chdir = TRUE)
  mmnorm <-
 function (data,minval=0,maxval=1) 
 {
 d=dim(data)
 c=class(data)
 cnames=colnames(data)
 classes=data[,d[2]]
 data=data[,-d[2]]
 minvect=apply(data,2,min)
 maxvect=apply(data,2,max)
 rangevect=maxvect-minvect
 zdata=scale(data,center=minvect,scale=rangevect)
 newminvect=rep(minval,d[2]-1)
 newmaxvect=rep(maxval,d[2]-1)
 newrangevect=newmaxvect-newminvect
 zdata2=scale(zdata,center=FALSE,scale=(1/newrangevect))
 zdata3=zdata2+newminvect
 zdata3=cbind(zdata3,classes)
 if (c=="data.frame") zdata3=as.data.frame(zdata3)
 colnames(zdata3)=cnames
 return(zdata3)
 }
load("/Users/davidwinsemius/Downloads/dprep/data/my.iris.rda")
radviz2d(my.iris,"Iris")

该软件包还有其他几个功能，包括R中可用的调查图，因此它们不需要编译。包中有编译功能，我没有调查过。

Answer 2

我发布了新版本的dprep。埃德加·阿库纳