猫,排序,20GB文件的gzip

时间:2015-04-01 00:04:35

标签: sorting cat

我内存不足以单独执行所有步骤,因此我在想或做这样的事情:

cat r_T_H_17.bed r_T_H_stim.bed r_T_mem.bed r_T_naive.bed r_T_reg.bed | sort -k1,1 -k2,2n -k3,3n | bgzip > all_r.bed.gz

所有文件都是最小12和最大23 GB,我打算在群集上运行它。这是否意味着我必须总结所有文件的大小以估计内存消耗?

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