读取带有标签的数据文件作为R中的距离矩阵

时间:2015-03-30 07:38:18

标签: r text matrix distance hierarchical-clustering

我是R的新手。我在文本文件中有一个距离矩阵,例如动物的基因组序列,如下所示:

cat 0.40 0.80 0.90
dog 0.80 0.35 0.85
bat 0.90 0.85 0.38 

我想将此文件作为dist对象阅读,因此我可以将其传递给hclust并绘制树形图(带标签)。

最好的方法是什么?我尝试将矩阵转换为dist,但我得到的行为我不明白:

# The above matrix, without labels
A <- matrix( c(0.4, 0.8, 0.9, 0.8, 0.35, 0.85, 0.9, 0.85, 0.38), nrow=3)
as.dist(A)
#      1    2
# 2 0.80     
# 3 0.90 0.85

我只想更改数据结构的类,而不是对它进行操作。

如何使用标签将文本文件中的数据传递给hclust?

0 个答案:

没有答案