需要从文件中删除字符串chr和％符号

Question

我有一个如下所示的文件

chrM    152 165 45  21.43%
chrM    13811   324 70  17.77%
chr1    1669566 47  14  22.95%
chr1    1685929 144 33  18.64%

我想从文件中删除字符串chr和%符号。这是一个tab分隔文件。我该如何在这里使用sed命令？

我的输出应该是：

M   152 165 45  21.43
M   13811   324 70  17.77
1   1669566 47  14  22.95
1   1685929 144 33  18.64

Answer 1

您可以使用sed或perl。

sed 's/^chr\|%$//g' file

由于基本sed使用BRE（ Basic Regular expression ），因此regex OR运算符由\|表示。

通过perl。

perl -pe  's/^chr|%$//g' file

Answer 2

如果%是该行的最后一个字符，这在sed中很简单：

sed 's/^chr//; s/%$//' file

第一个命令从行的开头删除chr，第二个命令从结尾删除%。

如果您想使用OR运算符，也可以组合这两个命令：

sed 's/^chr\|%$//g'

两种模式中的任何一种匹配 - 在这种情况下，我们还需要全局修饰符g，以便可以对同一行进行两种修改。 |运算符使用\进行转义。

要编辑文件，您可以使用-i开关（如果有），或执行标准技巧：

sed 's/^chr\|%$//g' file > tmp && mv tmp file