Question

我使用集群来处理我编写的脚本，并使用以下代码提交这些脚本：

bsub -n 10 < run.sh

提交脚本的开头通常如下所示：

#BSUB -J align[1-10]
#BSUB -e logs/run.%I.%J.err
#BSUB -o logs/run.%I.%J.out
#BSUB -R "span[hosts=1]"
#BSUB -n 10

我的问题是我的脚本是否会使用所有保留的处理器，即使代码没有以某种方式分解？所以如果我有一些非常简单的东西：

echo "this"

没有多个文件可以作用，是否仍然会使用多个处理器来计算或只使用一个处理器？如果它只使用一个处理器，我该如何使脚本使用多个？

Answer 1

我想如果有人想要一个简单的解释，我会回答这个问题。

  #BSUB -J array[1-3]

  #This creates a named array whose size matches that of the array created
  #on the first line
  files=(first.txt second.txt third.txt)

  #This refers to the 0, 1, or 2 item in the files array and sets as the
  #current file
  currentfile=${files[$(($LSB_JOBINDEX - 1))]}

  count = 0

  #Executes some code on each file individually
  while true
      do echo $count >> /dir/${currentfile}
          let "count+=1"
      done

使用BSUB将Bash脚本提交到群集

1 个答案: