我是生物信息学的新手，但我知道perl脚本。我写了很少的脚本来解析pdb文件（蛋白质晶体结构文件）。现在我想在Web服务器中运行它们。我在我的ubuntu中安装了apache2。我已经阅读了有关CGI的内容，并且在本地Web服务器的/usr/lib/cgi-bin/中。我需要在该目录中拥有所有perl脚本。这些脚本从命令行ex: perl contacts.pl pdbFile.pdb获取输入。
现在我如何在perl CGI脚本中运行这些脚本，以便CGI脚本动态抛出html页面并询问用户输入（这包括PHP我猜）。最后，我应该有一个html页面，可以在用户输入时运行我的perl脚本（contacts.pl）。
如果无法在html网页中运行我的perl脚本，那么另一种选择是什么？
非常感谢任何帮助。
答案 0 :(得分：2)
我不认为我会通过CGI运行一切。如果我是你，我会考虑使用perl web框架来处理生成网页和（可能）上传文件，然后调用现有代码来解析pdb文件并获得你感兴趣的任何内容
一些流行的框架：
至于运行网络服务器，他们应该有部署指南和apache说明。或者使用像starman这样的其他网络服务器，可以轻松运行perl webapps。
答案 1 :(得分：1)
首先，您可以从以下链接获得基本想法：