Question

我一直在使用R中的Hmisc包中的rcorr函数。我弄清楚它是如何工作的，我可以提取结果，把它们放在一张漂亮的表中。我查看了这篇文章：p-values of correlation coefficients。但是......剩下的一件事就是困扰我：如果p值= 0.0000怎么办？即使使用print语句添加更多数字，p值= 0。

print(M_rcorr$P, digits = 20)

这是否意味着它是一个非常显着的相关性？我的意思是，R的计算技能是否最大化，这就是为什么它只会返回“0”？

例如，在某些结果下面。

P
              Calcification Collagen Atheroma IPH    Macrophages Mastcells Neutrophils SMCs   Vessels
Calcification               0.0000   0.3390   0.0000 0.6488      0.0000    0.0063      0.0000 0.0000 
Collagen      0.0000                 0.0000   0.8866 0.7528      0.0000    0.0044      0.0000 0.0056 
Atheroma      0.3390        0.0000            0.0000 0.0000      0.7003    0.0000      0.0000 0.0063 
IPH           0.0000        0.8866   0.0000          0.0000      0.0474    0.0000      0.0000 0.0000 
Macrophages   0.6488        0.7528   0.0000   0.0000             0.0000    0.5536      0.0000 0.0000 
Mastcells     0.0000        0.0000   0.7003   0.0474 0.0000                0.0000      0.0001 0.0000 
Neutrophils   0.0063        0.0044   0.0000   0.0000 0.5536      0.0000                0.0000 0.0000 
SMCs          0.0000        0.0000   0.0000   0.0000 0.0000      0.0001    0.0000             0.0000 
Vessels       0.0000        0.0056   0.0063   0.0000 0.0000      0.0000    0.0000      0.0000

当我用“test $ P”进一步检查时，我会得到这个：

              Calcification     Collagen     Atheroma          IPH  Macrophages    Mastcells
Calcification            NA 3.552714e-15 3.389508e-01 6.436717e-06 6.487711e-01 8.083783e-10
Collagen       3.552714e-15           NA 0.000000e+00 8.865855e-01 7.527929e-01 3.092686e-05
Atheroma       3.389508e-01 0.000000e+00           NA 0.000000e+00 3.623466e-09 7.003210e-01
IPH            6.436717e-06 8.865855e-01 0.000000e+00           NA 1.728324e-05 4.742716e-02
Macrophages    6.487711e-01 7.527929e-01 3.623466e-09 1.728324e-05           NA 1.545497e-11
Mastcells      8.083783e-10 3.092686e-05 7.003210e-01 4.742716e-02 1.545497e-11           NA
Neutrophils    6.319943e-03 4.367848e-03 1.532108e-14 0.000000e+00 5.535871e-01 0.000000e+00
SMCs           3.185481e-05 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 0.000000e+00 1.081798e-04
Vessels        1.372520e-05 5.565543e-03 6.339438e-03 1.666998e-06 0.000000e+00 0.000000e+00

谢谢！

桑德

Answer 1

这是一个相当统计的问题，但我试着回答希望帮助你。如果您在零假设下无法获得样本，您肯定会得到p值为零。要根据p值解释结果，请查看此处

http://www.graphpad.com/guides/prism/6/statistics/index.htm?stat_interpreting_results_correlati.htm

或在这里

http://www.eecs.qmul.ac.uk/~norman/blog_articles/p_values.pdf

Answer 2

确定。我想到了。当p值非常，非常，非常非常小时，p值将为零，以至于R不能再计算它。这是答案的实际部分，它只是意味着它在计算上不再可能。那就是说。可能在统计上/数学上不可能得到恰好为零的p值。

感谢您的想法，伙计们！

使用rcorr的相关矩阵中p = 0的含义是什么？

2 个答案: