ggplot图中未知的额外因子水平

Question

我正在使用ggplot，我不确定为什么我的图中会出现额外的因子水平。

这是我的数据帧的结构：

> str(Int_mltL)
'data.frame':   123144 obs. of  17 variables:
 $ File.name : Factor w/ 5864 levels "6-1_LB-1_P2-H-2_01_4587.mzXML",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
 $ variable  : Factor w/ 21 levels "peak1","peak2",..: 6 1 7 2 8 3 9 4 10 5 ...
 $ value     : num  597 203 255 0 130 ...
 $ valueL    : num  6.39 5.32 5.55 0 4.88 ...
 $ PA14_locus: Factor w/ 4434 levels "EMPTY","PA14_00020",..: NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ SmpType   : Factor w/ 32 levels "6","PA14_EM_1",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
 $ OD500     : num  NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ IntStd    : num  NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ PlNm96    : Factor w/ 61 levels "ExMr_nr_mas_01_1",..: NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ Col96     : chr  NA NA NA NA ...
 $ Row96     : chr  NA NA NA NA ...
 $ Cntrl     : chr  "LB" "LB" "LB" "LB" ...
 $ Locus     : Factor w/ 294 levels "","EMPTY","PA14_00680",..: NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ GeneName  : Factor w/ 12 levels "","pchC","pchD",..: NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ BMtype    : Factor w/ 4 levels "","pch","phz",..: NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
 $ Sum.valL  : num  86.1 86.1 86.1 86.1 86.1 ...
 $ Med.valL  : num  86.1 86.1 86.1 86.1 86.1 ...

我想要分组的因素（BMType）似乎有4个级别。但是出现了5个箱形图。什么是第5级，我该如何删除它。

谢谢

> unique(Int_mltL$BMtype)
[1] <NA> rhl  phz  pch      
Levels:  pch phz rhl