Python使用带有mpi4py的multiprocessing.pool生成无法分配内存错误

时间:2015-03-24 08:46:19

标签: python memory-leaks multiprocessing threadpool mpi4py

我正在研究一组计算机,最近开始使用python进行并行编程。

我目前的理解是:mpi4py有助于管理不同节点之间的工作,多处理管理节点核心中的工作。

我根据运行的proc数量将一个大的for循环划分为

comm.Get_size() = nprocs

然后尝试通过节点的cpu_count生成进程池,然后让它们工作。代码如下:

       if rank == proc:
            global output_dictionary
            output_dictionary = {}
            p=Pool(processes=cpu_count())                                                                                                     
            print "rank", rank, "started backpropagating. Async mapping..."
            results = []
            for key in serialize_and_divide(n_muscles,n_mn,rank,nprocs):
                r = p.apply_async(calc_neuronij_grad,key,callback=append_grads_list)
                results.append(r)
            for r in results:                                                                                                                     
                r.wait()                                                                                                                          
            p.close()
            p.join()

我的问题是,当代码到达p = Pool(processes = cpu_count())时,它会生成错误"无法分配内存"。 Traceback与Python cannot allocate memory using multiprocessing.pool相同,但解决方案没有帮助。

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