我有一个以篮子数据格式制作的数据集。我已经使用包调用arules在R中读取了该数据集,该包调用具有用于读取事务的内置函数,因此我使用它并读取我的数据集。以下是我使用的代码:
trans = read.transactions("C:/Users/HARI/Desktop/Graph_mining/transactional_data_v3.csv", format = "basket", sep=",",rm.duplicates=TRUE)
inspect(trans[1:5])
items
1 {,
ANTIVERT,
SOFTCLIX}
2 {,
CEFADROXIL,
ESTROGEN}
3 {,
BENZAMYCIN,
BETAMETH,
KEFLEX,
PERCOCET}
4 {,
ACCUTANE(RXPAK;10X10),
BENZAMYCIN}
5 {,
ALBUTEROL,
BUTISOLSODIUM,
CLARITIN,
NASACORTAQ}
正如您所看到的,当我使用inspect(trans)
时,它会显示每个事务中都有空列的事务。我的问题是如何删除那些空列?
对于dput
对象的完整trans
,请参阅this link。
答案 0 :(得分:3)
我想我找到了解决问题的方法。我拿了你的csv文件,在Excel中打开它并用NA替换所有空单元格。然后我将整个事情粘贴到LibreOffice Calc并将其保存回csv,指定双引号应该用于所有单元格(奇怪的是,Excel除了使用vba宏之外不会这样做。你可以直接读取文件但是,LibreOffice而不是Excel,用NA替换空单元将永远存在。然后:
trans <- read.table("d:/downloads/transactional_data_2.csv", sep=",", stringsAsFactors = TRUE, na.strings="NA", header=TRUE)
trans2 <- as(trans, "transactions")
inspect(trans2[1:5])
<强>结果
inspect(trans[1:5])
items transactionID
1 {X1=SOFTCLIX,
X2=ANTIVERT} 1
2 {X1=ESTROGEN,
X2=CEFADROXIL} 2
3 {X1=KEFLEX,
X2=BETAMETH,
X3=PERCOCET,
X4=BENZAMYCIN} 3
4 {X1=BENZAMYCIN,
X2=ACCUTANE(RXPAK;10X10)} 4
5 {X1=CLARITIN,
X2=ALBUTEROL,
X3=NASACORTAQ,
X4=BUTISOLSODIUM} 5
我认为这是你正在寻找的结果......?
答案 1 :(得分:2)
我对arules包不太熟悉。我最好的猜测是使用read.csv
读取数据,然后转换为事务格式,而不是使用提供的read.transactions
:
tran2 <- read.csv("downloads/transactional_data.csv")
tran3 <- as(tran2, "transactions")
编辑:我认为数据中的空白没有被正确读取;此外,还有重复项,也应该过滤掉。这应该处理。您需要reshape2
包。
trans2 <- read.csv("downloads/transactional_data.csv", na.strings="", stringsAsFactors=FALSE )
trans2$id <- seq(nrow(trans2))
t2.long <- melt(trans2, id.vars="id")
t2.long$variable <- NULL
t3 <- as(lapply(split(t2.long$value, t2.long$id), unique), "transactions")