我是使用Vegan进行生态系统级分析的新手。
我有一个数据集,在10个站点上有超过4,000个分类群,另有10个站点有37个基于化学的观察。
我使用来自Vegan包的prcomp分析了这两组数据,并使用biplot(df)绘制了结果,并且正如预期的那样,它对化学数据看起来很棒,但产生(如预期的)一个荒谬的不可读的分类数据图。
我在一个网站上读到,你可以根据驱动情节的那些变量的加载值来绘制一个双标图 - 在他们的例子中,为了清晰起见,他们只从他们的prcomp结果中绘制了前10个加载变量,但是他们省略了他们是如何做到的。 (见http://www.pmc.ucsc.edu/~mclapham/Rtips/ordination.htm)
根据加载(旋转)值阅读并搜索如何绘制数小时后,我无法找到答案。任何人都可以帮我弄清楚如何将我的变量缩小到最重要的变量而不是全部查看4,000个变量吗?
提前谢谢你。 伊那