我正在考虑从MATLAB切换到Python。我的MATLAB代码的核心在几千个数字的数组上重复调用erf,如:
r=rand(1,1e5)
erf(r)
这是我在Python中的实现:
import numpy as np
import scipy.special as sps
r=np.random.rand(1e5)
sps.erf(r)
Python版本大约需要三倍的时间。如果我使用Cython来编译程序的这个核心,我会看到一个主要的加速吗?我没有很少的Python经验,也没有C经验,所以我想在尝试找出Cython之前我会在这里查看。
答案 0 :(得分:6)
我不希望Cython能够加快速度。所有耗时的工作都在sps.erf
和np.random.rand
内进行; Python解释器只是传递数组。
在MATLAB术语中,当您无法完全向量化计算时,Cython最有可能提供帮助。
您可能需要考虑向SciPy开发人员报告此性能差异。也许有一个很容易修复的错误。