如何在python中为Bokeh图添加误差线？

Question

我已经使用Bokeh成功绘制了几个数据集和拟合函数但是我真的需要在图表中添加误差条，我该怎么做呢？

Answer 1

编辑：现在内置于Bokeh中，请参阅文档：

https://bokeh.pydata.org/en/latest/docs/user_guide/annotations.html#whiskers

和

https://bokeh.pydata.org/en/latest/docs/user_guide/annotations.html#bands

有关完整示例，请参阅https://stackoverflow.com/a/46517148/3406693。

也许它有点晚了但我今天也想这样做。

很遗憾，散景本身并没有提供这个功能。

import numpy as np
from bokeh.plotting import figure, show, output_file

# some pseudo data
xs = np.linspace(0, 2*np.pi, 25)
yerrs = np.random.uniform(0.1, 0.3, xs.shape)
ys = np.sin(xs) + np.random.normal(0, yerrs, xs.shape)

output_file('bokeh_errorbars.html')

# plot the points
p = figure(title='errorbars with bokeh', width=800, height=400)

p.xaxis.axis_label = 'x'
p.yaxis.axis_label = 'y'


p.circle(xs, ys, color='red', size=5, line_alpha=0)


# create the coordinates for the errorbars
err_xs = []
err_ys = []

for x, y, yerr in zip(xs, ys, yerrs):
    err_xs.append((x, x))
    err_ys.append((y - yerr, y + yerr))

# plot them
p.multi_line(err_xs, err_ys, color='red')

show(p)

这就是结果：

有人可能希望将它用作这样的函数：

def errorbar(fig, x, y, xerr=None, yerr=None, color='red', 
             point_kwargs={}, error_kwargs={}):

  fig.circle(x, y, color=color, **point_kwargs)

  if xerr:
      x_err_x = []
      x_err_y = []
      for px, py, err in zip(x, y, xerr):
          x_err_x.append((px - err, px + err))
          x_err_y.append((py, py))
      fig.multi_line(x_err_x, x_err_y, color=color, **error_kwargs)

  if yerr:
      y_err_x = []
      y_err_y = []
      for px, py, err in zip(x, y, yerr):
          y_err_x.append((px, px))
          y_err_y.append((py - err, py + err))
      fig.multi_line(y_err_x, y_err_y, color=color, **error_kwargs)