Question

努力定义导致此错误的原因。

安装了anaconda并使用了conda install pysam，工作了一段时间但却突然出现此错误

>>> import pysam
Traceback (most recent call last):
  File "<stdin>", line 1, in <module>
  File "/Users/Nick/anaconda/lib/python2.7/site-packages/pysam/__init__.py", line 125, in <module>
    [ "SamtoolsError", "SamtoolsDispatcher" ] + list(SAMTOOLS_DISPATCH) +\
AttributeError: 'module' object has no attribute '__all__'

查看文件内部，相应的代码是

# hack to export all the symbols from csamtools
__all__ = \
    csamtools.__all__ + \
    ctabix.__all__ + \
    cvcf.__all__ +\
    [ "SamtoolsError", "SamtoolsDispatcher" ] + list(SAMTOOLS_DISPATCH) +\
    ["Pileup" ]

有什么原因导致这个???

Answer 1

好的，使用conda卸载，也使用pip卸载，然后pip重新安装似乎解决了它。

仍然在模块的其他部分出现一些错误，但正在修复。

感谢您的建议！

pysam模块导入导致错误

1 个答案: