邻居在R中的igraph包中起作用

Question

首先，我想说我已经阅读了问题的答案：“问题与R”igraph“包邻居功能”，我试图解决我的问题，但我不能。我试图将我的问题作为后续评论，但由于声誉水平低我无法做到，因此我打开了这个新问题。现在这是我的问题： 我对邻居函数有同样的问题，因为它已在下面解释： "igraph” package neighbor function但是当我尝试由Gabor Csardi给出的解决方案时，我刚收到null作为结果。我也在这里附上了我的代码部分。我会非常感谢任何帮助和回答。 我的桌子：

edgelist <- read.table(text = "
1 2
2 3
3 4
4 5
3 6
6 7")
library(igraph)
graph <- graph.data.frame(edgelist)

str(graph)
## IGRAPH DN-- 7 6 -- 
## + attr: name (v/c)
## + edges (vertex names):
## [1] 1->2 2->3 3->4 4->5 3->6 6->7

现在，如果我想要节点3的邻居，那么它应该是

2, 4, 6

但我得到的结果是：

2, 4, 5

我注意到它改变了我的节点的顺序。正如我之前解释的那样，我尝试了在堆栈溢出中找到的解决方案，但结果是null：

graph$name[neighbors(graph, 3)]
   NULL

我不知道我还能做什么， 我将不胜感激任何帮助。

Answer 1

在开始之前，您应该小心不要混淆标签/名称和给定顶点的索引/编号。当你使用这两个数字作为标签和指标时，事情很快就会变得混乱。为了避免混淆，我在这里使用了字母

edgelist <- read.table(text = "
A B
B C
C D
D E
C F
F G")  

library(igraph)
graph <- graph.data.frame(edgelist)
str(graph)
#IGRAPH DN-- 7 6 -- 
# + attr: name (v/c)
# + edges (vertex names):
# [1] A->B B->C C->D D->E C->F F->G

要了解处理的内容，我们将其绘制出来：

plot(graph)

要获得邻居的索引，请执行以下操作： （记住有一个mode参数）

neighbors(graph, 3, mode = "total")  # Index of neighbours by index
## [1] 2 4 5
neighbors(graph, "C", mode = "total")  # Index of neighbours by label
## [1] 2 4 5

要做Gabor建议你需要做的事情。 （我认为他错过V( )并写了graph$name，当他在帖子中提到V(graph)$name时

# Label of neighbours by label
V(graph)$name[neighbors(graph, "C", mode = "total")]
## [1] "B" "D" "F"

这给出了相应的＆＃34;邻居＆＃34;的标签。 这与图像一致。

编辑糟糕。我搞砸了。使用E()代替V()。它似乎按预期工作。遗憾。

Answer 2

或者，您可以使用哪个来为您提供所需的索引：

neighbors(g,which(V(g)$name %in% 'A'),mode='in')